Используемый для паттерна участок (88-114):
Характеристика паттерна | Паттерн | В скольких последовательностях банка Swiss-Prot найден мотив, удовлетворяющий паттерну? | Все ли последовательности из Вашего выравнивания найдены? |
Фрагмент последовательности | F-A-K-L-T-E-Q-V-K-E-Q-G-S-K-I-G-I-Q-L-A-H-A-G-R-K-A | 1 | Нет |
Сильный | [FILH]-[RFAK]-[ETK]-[MIL]-[TA]-[DE]-[AQ]-V-[HK]-[EQS]-[EYQA]-G-[AGS]-[VK]-[IM]-[MAFG]-[MIL]-Q-[IL]-[ILHAW]-H-[LTAG]-G | 4 | Нет |
Слабый | [EDTK]-[MILV]-x-[DE]-x-[VLIA]-[HK]- x(1,2)-[VLIA]-x(1,2)-[MILV]-x-[MILV]-[QN]-[IL]-x-[WRKH]-x-[VLIA] |
8 | Да |
Мотивы в NAMA_BACSU :
Идентификатор документа PROSITE (AC) | Название мотива | Краткое описание мотива | Тип подписи (паттерн, профиль) | Паттерн (регулярное выражение) | Специфична ли подпись? | Сколько мотивов нашлось в белке? |
PS00008 | MYRISTYL | Сайт N-миристоилирования | Паттерн | G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} | Неспецифичен | 4 |
PS00009 | AMIDATION | Сайт амидации | Паттерн | x - G - [RK] - [RK] | Неспецифичен | 1 |
PS00006 | CK2_PHOSPHO_SITE | Сайт фосфорилизации казеиновой киназы II | Паттерн | [ST] - x(2) - [DE] | Неспецифичен | 8 |
PS00005 | PKC_PHOSPHO_SITE | Сайт фосфорилизации казеиновой киназы C | Паттерн | [ST] - x - [RK] | Неспецифичен | 3 |