Контакты с лигандом в yqjM_BACSU.

Исследуемый объект - флавиномононуклеотид (FMN).

Имя атома контакта Имя контактирующего атома белка Расстояние в Å Предположительная природа контакта
FMN1500A.O2
HIS164A.R (ND1) (заряженный радикал гистидина) 3,37 Электростатическое взаимодействие?
HIS167A.R (NE2) 3,73
GLN102A.NE2 [N-H] 2,79 Водородные связи?
ARG215A.NH1 [N-H] 2,90
FMN1500A.O3'
3,02
FMN1500A.O1P
ARG308A.NH2 [N-H] 2,82
FMN1500A.O2'
ARG215A.NH1 [N-H] 3,19
FMN1500A.O4
CYS26A.SG [S-H] 3,17

Есть подозрение,что контакт может как-то идти через диполи молекулы воды.

Исследуемый объект - сульфат-ион (SO4).

>
Имя атома контакта Имя контактирующего атома Расстояние в Å Предположительная природа контакта
SO41502A.O2 HIS167A.ND1 2,82 Электростатическое взаимодействие?
HIS164A.NE2 3,24
SO41502A.O3/O4 Кислород H2O ≈ 2,7 Водородные связи?
SO41502A.O1 TYR169A.OH 2,70
SO41502A.O4 2,78

©Турал Я.Я.