Примеры контактов между боковыми группами а.о.

• Примеры разных гидрофобных контактов в молекуле белка NAMA_Bacsu.
  

  	Гидрофобные кластеры. Предположительно взаимодействующие атомы окрашены в оранжевый цвет. Первый пример более интересен тем, что связаны а.о. из разных цепей белка. Расстояния во втором примере варьируются от 3,69 (между фенилаланинами) до 4,32 (между фенилаланином и валином)
  	Донорно-акцепторный механизм связи. Донор водорода - GLU162.OE1 (OH-группа) Акцептор - ASP247.OD1 (кислород)
  	Донорно-акцепторный механизм связи. Донор водорода - ARG48.NH1 (аминогруппа) Акцептор - HIS44.ND1 (азот)

  Ввиду отсутствия в NAMA_Bacsu дисульфидных мостиков - инсулин, его структура.
  

  Дисульфидные мостики, или диcульфидная связь — ковалентная связь между двумя атомами серы, входящими в состав серусодержащей аминокислоты цистеина. Дисульфидные связи образуются в процессе послетрансляционной модификации белков и служат для поддержания третичной и четвертичной структур белка. Длина такой связи равна ≈ 2,05 Å.

  Фенилаланин, его контакты.
  
  

  

  
  Здесь изображен ароматический альфа-а.о. фенилаланин, также его контакты с окружающими а.о.
  Предположительно контактирующие атомы изображены в виде небольших окрашенных шариков.
  Серый цвет - углерод.
  Красный цвет - кислород.
  Голубой цвет - азот.
  Черный цвет - альфа-углерод.

  ---

  ©Турал Я.Я.