Учебный сайт Шиндяпиной А.В.

Диагностические позиции выравнивания.


Диагностические позиции выравнивания те, которые принадлежат всем последовательностям данного таксона и не принадлежат последовательностям других таксонов.
Для поиска таких последовательностей взяла выравнивания 7 белков бактерий из предыдущего занятия - eftsv.fasta . Получила следующие изображения:


Красным покрашены диагностичпские позиции для семейства Enterobacteriales, к которому из представленных относятся ERWCT и ENT38. Синим - для класса Betaproteobacteria. Логично, что для семейства таких позиций больше.



Здесь покрашены позиции для класса Gammaproteobacteria.





©, "ООО Шиндяпина 2008"