Учебный сайт Шиндяпиной А.В.

Контакты сульфат-иона с белком PTHP_E.coli по данным записи 0opd

В качестве лиганда, контактирующего с моим белком PTHP_E.coli, выбрала сульфат-ион. Было задано расстояние 5А, на этом расстояние от лиганда находятся следующие атомы белка:
НIS15: CA,C,O,CB,CG,ND1,CD2,CE1,NE2
THR16: N,CA,C,CB,OG1,CG2
ARG17: N,CA,C,CB,CG
PRO18: N,CG,CD

множество атомов белка, контактирующих с сульфат-ионом

Для иллюстрации контакта лиганда и белка выбрала множетво атомов THR16

Слева расположен сульфат-ион, справа атомы THR16, контактирующие с ним