Химическое строение нуклеиновых кислот

Тетрануклеотид TCAG

На данном рисунке изображена полученная с помощью ChemSketch схема тетрануклеотида TCAG.
Красным выделен сахарофосфатный остов, фиолетовым – атомы азота оснований, участвующие в N-гликозидной связи.

Cтруктуры нуклеозидов уридина и псевдоуридина

Структуры уридина и псевдоуридина отличаются типом атома основания, присоединяющегося к первому углероду рибозы и, соответственно, видом связи: у уридина – N-гликозидная, у псевдоуридина – гликозидная.

Канонические пары

Для каждой возможной пары "пурин-пиримидин" были изображены различные варианты взаимодействия с помощью водородных связей.
Оптимальными являются канонические пары, которые образуют большее число водородных связей, то есть, попросту говоря, крепче связаны. В особенности это пара G–C. В ней гуанин контактирует с цитозином посредством образования трех связей, в паре же A–T две такие связи.

Неканонические пары

Рассмотрим взаимодействие A-C.
Первые две пары более устойчивы, чем третья и четвертая, и будут возникать с большей вероятностью из-за стерических эффектов.

Взаимодействие A-T:

Взаимодействие G-T: