Главная страница третьего семестра

Командная строка UNIX

Команда

infoseq sw:rs3_ecoli > rs_ecoli.info

В файле была найдена такая информация:

# USA             Name        Accession Type Length	Description
sw-id:RS3_ECOLI   RS3_ECOLI     P0A7V3	P    232	30S ribosomal protein S3.

Команда

infoseq -help stdout > infoseq.help

В файле была найдена такая информация:

   Standard (Mandatory) qualifiers:
  [-sequence]          seqall     Sequence database USA

   Additional (Optional) qualifiers:
   -outfile            outfile    If you enter the name of a file here then
                                  this program will write the sequence details
                                  into that file.
   -html               boolean    Format output as an HTML table

   Advanced (Unprompted) qualifiers:
   -only               boolean    This is a way of shortening the command line
                                  if you only want a few things to be
                                  displayed. Instead of specifying:
                                  '-nohead -noname -noacc -notype -nopgc
                                  -nodesc'
                                  to get only the length output, you can
                                  specify
                                  '-only -length'
   -heading            boolean    Display column headings
   -usa                boolean    Display the USA of the sequence
   -name               boolean    Display 'name' column
   -accession          boolean    Display 'accession' column
   -gi                 boolean    Display 'GI' column
   -version            boolean    Display 'version' column
   -type               boolean    Display 'type' column
   -length             boolean    Display 'length' column
   -pgc                boolean    Display 'percent GC content' column
   -description        boolean    Display 'description' column

   General qualifiers:
   -help               boolean    Report command line options. More
                                  information on associated and general
                                  qualifiers can be found with -help -verbose

С помощью команды man были созданы следующие файлы с разными вариантами о директории :


©Надя Шашина