| Метка поля | Содержание | |
|---|---|---|
| Код(ы) доступа ("Accession number") | AC | P0A935; P46885; P76638; Q2MA21; Q46928 |
| Идентификатор записи в БД | ID | MLTA_ECOLI |
| Название (краткое описание) белка | DE | Membrane-bound lytic murein transglycosylase A Murein hydrolase A Mlt38 Связанная с мембраной муреиновая литическая трансгликозилаза А EC=4.2.2.n1 |
| Дата создания документа | DT | 19.06.2005 |
| Дата последнего исправления аннотации | DT | 16.12.2008 |
| Число публикаций, использованных при создании документа | RN | 5 |
| Журнал и год самой поздней публикации | RL | Mol. Syst. Biol. 2:E1-E5(2006) |
| Ключевые слова | KW | 3D-structure; Cell membrane; Cell outer membrane; Cell wall biogenesis/degradation; Complete proteome; Direct protein sequencing; Lipoprotein; Lyase; Membrane; Palmitate; Signal Трехмерная структура; Клеточная мембрана; Внешняя мембрана клетки; Биогенез/деградация клеточной стенки; Полный протеом; Прямое секвенирование белка; Липопротеин; Лиаза; Мембрана; Пальмитат; Сигнал |
| Что содержит поле комментариев? | CC | Поле комментариев содержит информацию о функциях, каталитическом действии, био-физико-химических свойствах, свойствах субъединицы, взаимодействиях и расположении белка в клетке |
| Идентификаторы записей PDB | DR | 2AE0; 2GAE; 2PI8; 2PIC; 2PJJ; |
С помощью каких физических факторов вы бы стали водействовать на Ваш белок,чтобы инактивировать его?
| Запрос | Число записей в SwissProt |
Число записей в TrEMBL |
| "Membrane-bound lytic murein transglycosylase A" | 27 | 158 |
| "EC=4.2.2.n1" | 177 | 0 |
| "Murein hydrolase A" | 7 | 0 |
| Метка поля | MLTA_ECOLI (мой белок) | MLTA_VIBCH (выбранный белок) | |
|---|---|---|---|
| Первый код доступа | AC | P0A935 | Q9KPQ4 |
| Идентификатор последовательности в БД | ID | MLTA_ECOLI | MLTA_VIBCH |
| Название (краткое описание) белка | DE | Membrane-bound lytic murein transglycosylase A Murein hydrolase A Mlt38 EC=4.2.2.n1 |
Membrane-bound lytic murein transglycosylase A Murein hydrolase A EC=4.2.2.n1 |
| Дата создания документа | DT | 19.07.2005 | 24.01.2001 |
| Дата последнего исправления аннотации | DT | 16.12.2008 | 25.11.2008 |
| Название организма | OS | Escherichia coli (strain K12) | Vibrio cholerae |
| Классификация организма (список таксонов) | OC | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia. | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Vibrionales; Vibrionaceae; Vibrio. |
| Длина последовательности | SQ | 365 | 368 |
| Молекулярная масса белка | SQ | 40411 | 40458 |
| Число публикаций, использованных при создании документа | RN | 5 | 1 |
| Журнал и год самой поздней публикации | RL | Mol. Syst. Biol. 2:E1-E5(2006) | Nature 406:477-483(2000) |
| Описание вторичной структуры | FT | В этих полях перечислены все элементы вторичной структуры: альфа-спирали, бета-тяжи и бета-повороты - известные из данных статей, по которым составлялась запись | Перечень элементов вторичной структуры отсутствует |
| Ключевые слова | KW | 3D-structure; Cell membrane; Cell outer membrane; Cell wall biogenesis/degradation; Complete proteome; Direct protein sequencing; Lipoprotein; Lyase; Membrane; Palmitate; Signal Трехмерная структура; Клеточная мембрана; Внешняя мембрана клетки; Биогенез/деградация клеточной стенки; Полный протеом; Прямое секвенирование белка; Липопротеин; Лиаза; Мембрана; Пальмитат; Сигнал |
Cell membrane; Cell outer membrane; Cell wall biogenesis/degradation; Complete proteome; Lipoprotein; Lyase; Membrane; Palmitate; Signal Клеточная мембрана; Внешняя мембрана клетки; Биогенез/деградация клеточной стенки; Полный протеом; Липопротеин; Лиаза; Мембрана; Пальмитат; Сигнал |
| Темы, освещённые в комментариях | CC | Поле комментариев содержит информацию о функциях, каталитическом действии, био-физико-химических свойствах, свойствах субъединицы, взаимодействиях и расположении белка в клетке | Поле комментариев содержит информацию о функциях, каталитическом действии и расположении белка в клетке |
| Особенности последовательности |
FT | В этом поле перечислены такие особенности последовательности, как аминокислотные цепи, липиды, альфа-спирали, бета-тяжи, бета-повороты, которые встречаются во многих белках. Также отмечены несоответствия данных из разных статей, использованных для создания записи | В этом поле перечислены такие особенности последовательности, как аминокислотные цепи и липиды, которые встречаются во многих белках |
| Идентификаторы записей PDB | DR | 2AE0; 2GAE; 2PI8; 2PIC; 2PJJ | Отсутствуют |
Вполне очевидно, что данные два белка, как они и должны быть, близки друг другу по свойствам. Наблюдаются некоторые расхождения, в том числе из-за большого "возраста" данных для белка MLTA_VIBCH, например отсутствие описания его вторичной структуры: сомнительно что в данном белке не присутствует подобных образований, но вероятно что они не были приведены в устаревшей статье о белке. В целом белки выполняют одинаковую функцию в разных организмах.
Из списка записей UniProt, содержащих информацию о тех белках, чье описание близко описанию моего белка (по запросу "Membrane-bound lytic murein transglycosylase A"), третичная структура неизвестна ни для одного белка. С другой стороны, для моего белка известно целых пять вариантов структуры.