Московский Государственный Университет имени М.В.Ломоносова Факультет Биоинженерии и Биоинформатики Учебный сайт Сеферяна Мелика

Полезные ссылки

Работа с системой PubMed.

Обязательные задания.

1. Найдено 8 статей в PubMed, в которых упоминается полное название белка RISA_ECOLI - Riboflavin synthase alpha chain.

2. Названия этих статей сохранены в текстовом файле: query1.txt

3. Одна из этих статей называется "The lumazine synthase/riboflavin synthase complex of Bacillus subtilis. X-ray structure analysis of hollow reconstituted beta-subunit capsids.". Авторы: Ladenstein R, Ritsert K, Huber R, Richter G, Bacher A.
Аннотация сохранена в файле: abstract.txt
Последний автор этой статьи - Bacher A. за последние 3 года сделал 53 публикации в PubMed.
Их названия сохранены в файле: query2.txt

4. Если в строке поиска ввести shingles то система сама подберет научное название опоясывающего лишая - herpes zoster и будет искать оба варианта. В итоге запрос выглядит так: "herpes zoster"[MeSH Terms] OR ("herpes"[All Fields] AND "zoster"[All Fields]) OR "herpes zoster"[All Fields] OR "shingles"[All Fields]
Аннотации первых двадцати статей, найденных по данному запросу сохранены в файле: query3.txt

Дополнительные задания.

1. Нужно найти ссылки на статьи о кровотечении из носа при гипертонии.
Запрос: ("epistaxis"[MeSH Terms] OR "epistaxis"[All Fields] OR "nosebleed"[All Fields]) AND ("hypertension"[MeSH Terms] OR "hypertension"[All Fields]). То есть научное название кровотечения из носа - epistaxis.
Найдено 192 статьи. Результаты сохранены в файле query_add1.txt

2.Нужно найти ссылки на публикации о генетически модифицированной еде.
Запрос: "food, genetically modified"[MeSH Terms] OR ("food"[All Fields] AND "genetically"[All Fields] AND "modified"[All Fields]) OR "genetically modified food"[All Fields] OR ("genetically"[All Fields] AND "modified"[All Fields] AND "food"[All Fields]) Найдено 2403 статьи. Результаты в виде списка аннотаций сохранены в файле query_add2.txt

3. Нужно найти статьи о болях зуба мудрости.
MeSH рекомендует нам переводить зуб мудрости как third molar, а боль - как pain
Запрос: ("molar, third"[MeSH Terms] OR ("molar"[All Fields] AND "third"[All Fields]) OR "third molar"[All Fields] OR ("third"[All Fields] AND "molar"[All Fields])) AND ("pain"[MeSH Terms] OR "pain"[All Fields])
Определение термина third molar (зуб мудрости) согласно MeSH - "The aftermost permanent tooth on each side in the maxilla and mandible" - что в переводе означает "Крайний коренной зуб на каждой из сторон верхней и нижней челюсти."

4. Упражнение (на использование раздела Limits):
В каком журнале было опубликовано больше статей - "Nature" или "Science"?. А посвященных раковым заболеваниям?