Второй семестр
Результаты упражнений
Блок 1.
Белок AAT_ECOLI в базах данных Swiss-Prot и TrEMBL.
Работа с системой SRS.
Выравнивание вручную.
Матрицы замен.
Блок 2.
Матрицы переходов глобального и локального выравниваний.
Программы построения выравниваний.
Работа с программой BLAST.
Блок 3.
Сравнение фрагментов выравниваний. Работа с ClustalW и SMART.
Создание паттернов. Множественные выравнивания.
Мотивы в белке AAT_ECOLI, описанные в БД Prosite.
Доменная структура белка AAT_ECOLI по данным Pfam.
Работа с InterPro.
Блок 4.
Работа с PSI-BLAST.
Филогенетические деревья, реконструированные разными способами.
©
Ганчарова Ольга