Комментарии
Взял посл-ти белков PUR3_ECOLI и PUR3_BACSU .
Процесс построения выравниваний у всех трех программ cхож.
На начальном участке выравнивания полностью совпадают.
Далее произошел сдвиг выравниваний emma и muscle относительно выравнивания needle на 1 а.о.
Этот сдвиг вызван различными методами построения выравниваний данными тремя программами.
Needle выравнивал именно две данные посл-ти.
Выравнивания же muscle и emma получены посредством множественного выравнивания.
Лучшие по числу консервативных колонок - выравнивания,созданные muscle и needle.
Причем выравнивание,построенное needle,содержит больше на 1 консервативную
колонку чем выравнивание,построенное muscle.
©Голяев Виктор