Альфа спираль номер 7

Красным отмечена выбранная
для изучения альфа спираль

Отмечены все водородные связи между атомами в альфа спирали
Крупно показана водородная связь между атомами кислорода из THR166 и азота из GLN170

При изучении торсионных углов в альфа спирали 7 обнаружены следующие значения:
Среднее значение Phi -66,9
Среднее значение Psi -30,0
Макс.Phi -51,3
Мин.Phi -92,2
Макс.Psi 167,8
Мин.Psi -53,6

Таблица. Контакты альфа-спирали 143-161 с остальной частью цепи А белка из записи PDB 1C2T:

Имя атома остатка спирали Имя контактирующего атома Расстояние в A Предположительная природа контакта
TRP183A.O LEU189A.N 3,336 Водородное взаимодействие
ASP186A.C ARG188A.CG 4,158 Гидрофобное взаимодействие
ASP186A.O ARG188A.N 3,057 Водородное взаимодействие
ASP186A.CA GLY187A.CA 3,797 Гидрофобное взаимодействие

©Голяев Виктор