Изображение области связывания MO2 с белком GroEL

Первый семестр
MO2.Mg++- ион магния, входящий в состав лиганда MO2, ATP.O2A- один из атомов кислорода молекулы АТФ, связанной с MO2, ASP.OD1- атом кислорода аспарагиновой кислоты, связанный с ионом магния электростатическим взаимодействием.
Данная область выделена с помощью программы RasMol.

Проект генноиженерного эксперимента

В данном белке с ионом магния связан остаток аспарагиновой кислоты (ASP), содержащей дополнительную карбоксильную группу. Связывание с ионом магния (MO2.Mg++) обеспечивается наличием атома кислорода, несущего сильный отрицательный заряд. При замене остатка аспарагиновой кислоты на аминокислоту с радикалом, содержащим, например, аминогруппу, комплекс с магнием не будет образовываться из- за отсутстствия электростатического притяжения между ионом металла и аминогруппой, так как аминогруппа может нести положительный заряд. Кроме того, к нарушению взаимодействия приведёт замена гидрофильной аспарагиновой кислоты на любую гидрофобную. Комплекс не будет образовываться и при замене аспарагиновой кислоты на серосодержащий цистеин, проявляющий кислотные свойства, так как ион магния связан с атомом кислорода не соединённым с водородом, как это видно на рисунке. Единственной заменой, которая не нарушит связывания белка с ионом магния, будет замена аспарагиновой кислоты на глутаминовую, также содержащую дополнительную карбоксильную группу.
Первый семестр


©Роман Зуев