Данные InterPro о белке CHEY_ECOLI

Описание документа InterPro
  • идентификатор документа InterPro: IPR001789
  • название документа InterPro: Response regulator receiver
  • количество белков с данной подписью: 6931

Все подписи, на которые есть ссылки в данном документе
Название базы данных Идентификатор Имя подписи Число белков
ProDom PD000039 Response_reg 6791
Pfam PF00072 Response_reg 6667
PROSITE profile PS50110 RESPONSE_REGULATORY 6822
SMART SM00448 REC 6141

Описание степеней родства и вложенности между подписями

     Как мы видим, в InterPro есть много подписей, таких что все белки, им удовлетворяющие, описываются данной (IPR001789). В то же время есть подписи не перекрывающиеся с данной по белкам на 100%. Только одна подпись перекрывается с IPR001789 по описанным в них аминокислотам.

     Эта подпись (IPR008327), считается родительской.
Ниже Вы можете увидеть практически то же самое, но очень хитро названное.

Дерево родства
IPR001789 : Response regulator receiver FOUND IN: (IPR006291:Heavy metal response regulator, IPR008246:Response regulator, LytTR DNA-binding AlgR/VirR/ComE type, IPR008247:Response regulator of citrate/malate metabolism, IPR008248:Chemotaxis response regulator, CheB type, IPR008327:Response regulator antiterminator, IPR008328:Response regulator with an HD-GYP region, IPR008329:Response regulator, RegA/PrrA/ActR type, IPR009184:Tripartite hybrid signal transduction histidine kinase, BarA type, IPR009219:Bacteriophytochrome, CheY-like, IPR010114:Nitrogen regulation protein NR(I), IPR011376:Response regulator of heterocyst pattern formation PatA, IPR011879:Phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB, IPR012052:Sporulation response regulator, Spo0A)
Расположение мотивов в последовательности белка CHEY_ECOLI

Описание всех известных подписей о белке CHEY_ECOLI, собранные в БД InterPro
Название подписи Положение в последовательности CHEY_ECOLI Полное название базы данных Название организации, поддерживающей данную БД. Страна   и город
Response_reg 6-124 ProDom Centre de Toulouse Франция, Тулуза
response_reg 5-127 Pfam Sanger Institute Англия, Хингстон
RESPONSE_REGULATORY 6-123 prosite Swiss Institute of BioinformaticsШвейцария, Женева
HTHFIS 18-35; 123-128 Sprint University of Manchester Bioinformatics Education and Research Англия, Манчестер
CheY_like 3-125 Superfamily The Laboratory of Molecular Biology Англия, Кембридж


© Решетов Денис, 2005