На главную
Term2

S R S


Таблица 1. Группы банков данных
Банк данных Группа
MedLine Literature, Bibliography and Reference Databases
UniProtKB UniProt Universal Protein Resource
UniRef100 UniProt Universal Protein Resource
EMBL Nucleotide sequence databases
PDB Protein function, structure and interaction databases

Таблица 2. Таксон гамма-протеобактерии
Латинское название таксона Gammaproteobacteria
Количество документов в Swiss-Prot 43434

Таблица 3. Запросы
Цель Строка запроса Количество найденных документов
Найти белок по AC [swissprot-AccNumber:P68187*] 1
Найти документы, описывающие белки из таксона «гамма-протео бактерии», схожие с белком MALK_ECOLI (в поле DE) ([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & [swissprot-Description:maltodextrin*]) (если в поле DE вводить более подробное описание белка MALK_ECOLI, то система ничего не находит) 9
Найти белки в организмах Yersinia pestis и Vibrio cholerae, схожие по функции с белком MALK_ECOLI (([uniref100-Organism:Yersinia pestis*] | [uniref100-Organism:Vibrio cholerae*]) & ((([uniref100-Description:ATP-binding*] & [uniref100-Description:protein*]) & [uniref100-Description:malK*]) | [uniref100-Description:ATP-binding protein malK*])) 2
Найти статьи, в которых упонимается полное название MALK_ECOLI ((((([swissprot-Description:Maltose/maltodextrin*] & [swissprot-Description:import*]) & [swissprot-Description:ATP-binding*]) & [swissprot-Description:protein*]) & [swissprot-Description:malK*]) | [swissprot-Description:Maltose/maltodextrin import ATP-bind ing protein malK*]) 26
Найти ссылки на статьи автора Нейфаха А.А. 1970-х годов ([medline-EntryDate:197?*] & [medline-Authors:Ne?f*,a.a*]) 18

Таблица 4. Описание выборки
Цель ID АС Организм Таксон
1 MALE_ECO57 P0AEY0 ESCHERICHIA COLI O157:H7 Maltose-binding periplasmic protein precursor (Maltodextrin-binding protein) (MMBP)
2 MALE_ECOLI P0AEX9 ESCHERICHIA COLI Maltose-binding periplasmic protein precursor (Maltodextrin-binding protein) (MMBP)
3 LE_ENTAE P18815 ENTEROBACTER AEROGENES (AEROBACTER AEROGENES) Maltose-binding periplasmic protein precursor (Maltodextrin-binding protein) (MMBP)
4 MALE_KLEPN Q05564 KLEBSIELLA PNEUMONIAE Maltose-binding periplasmic protein (Maltodextrin-binding protein) (MMBP) (Fragment)
5 MALE_PHOLU P41130 PHOTORHABDUS LUMINESCENS (XENORHABDUS LUMINESCENS) Maltose-binding periplasmic protein precursor (Maltodextrin-binding protein) (MMBP) (Fragment)
6 MALE_SALTY P19576 SALMONELLA TYPHIMURIUM Maltose-binding periplasmic protein precursor (Maltodextrin-binding protein) (MMBP)
7 MALZ_ECOLI P21517 ESCHERICHIA COLI Maltodextrin glucosidase (EC 3.2.1.20) (Alpha-glucosidase)
8 PHSM_ECOLI P00490 ESCHERICHIA COLI Maltodextrin phosphorylase (EC 2.4.1.1)
9 PHSM_KLEPN P07094 KLEBSIELLA PNEUMONIAE Maltodextrin phosphorylase (EC 2.4.1.1) (Fragment)

Выполненные задания в формате *.txt можно посмотреть здесь

Ссылку на SRS можно посмотреть здесь

Последовательность моего белка в файле P68187.fasta в формате "FastaSeqs" смотрите здесь

© Pouliakhina
All rights reserved