| Углами Psi и Phi называют углы вращения между N-C(A) и C(A)-C(O)
связями соответсвтенно.Значение этих углов для всей аминокислотной последовательности
определяет свертывание белка в пространстве.Для описания стереохимии белка
испльзуют карты Рамачандрана, дающие представление о наиболее оптимальном сочетаний
этих двуграных углов. Здесь представлены карты Рамачандрана для четырех цепей белка PYRD_Ecoli. Во всех случаях можно отметить 2 области, отвечающие стабильным конформациям. Область значений р районе (-50;-60) отвечает альфа-структуре белка,а область (125;100)бета структуре. Глицин,как остаток с наименьшими конформационными ограничениями, играет особую роль в формирование структуры белка.Как видно из карт,его значения рассредоточены по всему полю.Соответственно можно сделать вывод о том, что нахождение остатков глицина наиболе вероятно в местах резких поворотов полипепттидной цепи. |
|
|
|
 |
 |