Параметры PYRD_Ecoli

По форме белок напоминает Апеннинский полуостров с Е -полипептидной цепью в качестве о. Сицилия.

Оценка размеров белка

Задача Метод решения
Сколько молекул данного белка поместится в
одной клетке Escherichia coli,
если аппроксимировать клетку цилиндром
радиуса 0,5 микрометра и высоты 2микрометра
В связи со специфичностью формы белка наиболее рационально взять пару белков и аппроксимировать их сферой R=80 ангстрем.
Количечсто сфер-белков, которые можно поместить в заданный цилиндр-клетку узнаем так:
1. - вычислим сколько раз d сферы укладывается в высоту цилиндра.
2. -Сколько кругов,равных диаметрическому сечению сферы укладывается в основание цилиндра.(В предположении,что метод их расположения, представленный на иллюстрации наиболее оптимальньный.)
3. -преперножим результаты между собой и умножив на два.
Решение
1. Высота цилиндра 2*10^-6 метра d сферы=180*10^-10 метра
t= 2*10^ -6 /d=180*10^-10=125
2.R основания цилиндра =0.5*10^-6 R сферы=180*10^-10 метра g= 0.5*10^-6/80*10^-10 =62.4
3.Вычислим, сколько кругов мoжет находиться в каждом из 62 колец (включая центральную клекту-сферу).Зная,что L=3.38 R.
4. Тогда правомерна формула,составленная на основе формулы арифметической прогрессии и вычисляющая суму радиусов до середины каждого из 61 колец:
(2*R1+R(61-1)/2)*61
((2*120*10^-10+80*10^-10)/2)*61=(10^-10(240+80*60)*30.5 =153720*10^-10
5. Тогда длинна середин колец
L= 153720*10^-10 *3.28=965361.6*10^-10
Найдем сколько кругов помещыется в основание цилинда:
965361.6*10^-10 /160*10^-10 =6033.4
6.Учтем центральный:
6033+1=6034
7.Всего:
125*6034*2=1508500 молекул белка
Предположим, что все 4400 белков кишечной палочки
были синтезированы одновременно и в равных
количествах. Предположим, что размеры всех белков одинаковы и равны размерам данного белка.
Предположим, что в клетке ничего нет, кроме
белков. Сколькими мо лекулами будет представлен каждый белок?
Получаеся ,что в клетке бедет находиться 1508500 белков 4400 различных видов.
Тогда один вид белка будет представлен в количестве
1508500/4400 =342 молекул
Современные фирмы создают кристаллы CPU с
точностью до 0,13микрометров. Сколько молекул Вашего белк а поместится на линейке тако й длины?
Для вычислений используем пару белков аппроксимированн ых сферой R=80 ангстрем.
Тогда в линейку влезет:
(0.13*10^-6 /80*10^-10)*2 =32 белка
Первый семестр Главная страница


©Петрова Светлана,2007