Штамм Велгевонден (Университет Prestolia,Южная Африка)
- Линия происхождения: Протобактерия, Альфа-протобактерия
- Возбудители рода Реккетсиалез
- Cемейство : Анаплазматики
- Род : Ehrlichia (Эрхилия)
- Вид: ruminantium (Руминантиум)
- Штамм: Welgevonden (Велгевонден). Этот штамм был получен от клещей
и сохранен мышами. Самое большое отличие между геномом Е-руминантиум и
другими представителями Риккетсия Руминантиум - это наличие большого числа
повторяющихся последовательностей. Такие повторения составляют 8,5% от генома
и состоят из простых повторений последовательностей (SSR), больших тандемных
дупликаций и перемещающихся (деспергированных) повторений. Эти повторения
ассоциируются с 29-тью из 32-ух псевдогенов которые, похоже что возникают в
основном в процессе (тандемной) дупликации. В дополнении, считается что
SSR-ы (single sequencing reaction - единичные последовательные реакции)
могут играть роль в регуляции или фазовой вариации (расщепление на два
варианта). Полагается, что между 10-15% генов свободно живущие бактерии
приобретаются в результате горизонтальной передачи гена.
- Входящий номер генома: CR925678
Образец в наличие в Европейской Лаборатории Молекулярной Биологии.
- Таксономия (биосистематика): 254945
- Схематическое представление организации бактерии создано впервые Тодом
Гроесбеком, Национальный центр биотехнологии и информации.
Существующий (настоящий) образ вида недоступен.
- Геномный Проект / Исследование Генома:
Севенирование Генома (определение первичной структуры макромолекул)для
Вида Эрлихия руминантиум, штамм - Велгевонден, в Университете Претории,
Южная Африка - Завершено .Идентификационный номер проекта: 9614
Информация о геноме:
- Название RefSeq
- Таксономия в базе GenBank
- Длина 1.51635 п.о. (пары оснований / пары нуклеотидов).
- GC блок (Содержание гуанина и цитозина )27,5% в ДНК
- Cодержит888 Протеин.
- РНК имеет трехмерную структуру TaxMap CDD COG
- Хромосомы NC_006832
- СR 005295
При создании сайта использовались информация c ресурсов EBI и ECBI
Перевод статей © Пертова Светлана,2007
Общая информация об Эрлихии
Первый семестр
Главная страница
©Петрова Светлана,2007