ФББ
страница курса биоинформатики

Работа в PubMed

№1

Полное название моего белка- trpc e coli

Для начала ввел запрос без кавычек: trpc e coli

Было найдено 70 статей.

Потом попробовал запрос с кавычками: "trpc" and "e coli"

Было найдено 42 статьи.

№2

Воспользовался командой send to и сохранил результаты поиска по первому запросу в файле query1a.txt, а второго в файле query1.txt

№3

Выбрал статью- Kunisawa T. “Gene arrangements and phylogeny in the class Proteobacteria.” Воспользовался командой Abstract в меню PubMed, чтобы получить аннотацию статьи сохранил ее в файле abstract.txt Воспользовался системой для поиска автора за последние три года. Было найдено 6 публикаций. Результаты поиска сохранил в файле query2.txt

№4

Ввел в окно поиска название shingles. Было найдена 7941 статья. Первая страница виде аннотаций была сохранена в файле query3.txt PubMed распознает название shingles не всегда правильно, так как оно имеет несколько значений.( ("herpes zoster"[TIAB] NOT Medline[SB]) OR "herpes zoster"[MeSH Terms] OR shingles[Text Word])

Дополнительные задания.

№1

Я создал запрос: "nosebleed" and "hypertension" Было найдено 13 статей. Я сделал их аннотацию и сохранил в файле query_add1.txt PubMed распознает термин nosebleed нормально. Возможно это один из стандартных терминов PubMed.

№2

Я создал запрос: "genetically modified food" Было найдено 628 статей. Я сохранил первую страницу с аннотациями в файле query_add2.txt

№3

Название зуба мудрости- wisdom tooth или third molar Согласно MeSH зуб мудрости называется molar, third Я создал запрос: "wisdom tooth" and "pain" Получил 43 найденных статьи. Их аннотации я сохранил в файле query_add3.txt

№4

Я создал запрос с помощью команды Limits о всех статьях про рак за последние 10 лет. Limits: added to PubMed in the last 10 years, published in the last 10 years, Cancer Получил 2 статьи. Их аннотации я сохранил в файле query_add4.txt
Скачать протокол работы

На главную страницу

© Кирилл Довгань phoenix-wright@kodomo.fbb.msu.ru