Описание фрагмента вторичной структуры
Работа с программой RasMol
Исследовался бета тяж из остатков с номерами 10 12 14 38 и 40.
Данный рисунок отображает структуру этого тяжа (Пунктирной линиейотмечены водородные связи).

Паттерн водородных связей:
I(N) -------- 28 + I(O)
I(O) -------- 26 + I(N)
Можно заметить, что бета атомы углерода лежат над и под плоскостью тяжа, а связь между альфа и бета углеродными атомами почти перпендекулярны плоскости тяжа. Каждый следующий бета атом углерода смотрит в другое полупространство относительно тяжа, чем предыдущий.

Назад