Перекрывание Overlap area in Angstrom^2 between polygons defined by atoms on successive bases. Polygons projected in the mean plane of the designed base-pair step. Values in parentheses measure the overlap of base ring atoms only. Those outside parentheses include exocyclic atoms on the ring. Intra- and inter-strand overlap is designated according to the following diagram: i2 3' 5' j2 /|\ | | | Strand I | | II | | | | | \|/ i1 5' 3' j1 step i1-i2 i1-j2 j1-i2 j1-j2 sum 1 GC/GC 3.61( 0.82) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 4.25( 1.88) 7.86( 2.70) 2 CC/GG 1.89( 0.00) 0.00( 0.00) 0.08( 0.00) 4.83( 3.27) 6.81( 3.27) 3 CG/CG 2.34( 0.57) 0.00( 0.00) 1.64( 0.06) 0.00( 0.00) 3.98( 0.63) 4 GA/UC 2.87( 1.31) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 2.87( 1.31) 5 AG/CU 2.17( 2.08) 0.00( 0.00) 0.38( 0.00) 0.38( 0.00) 2.93( 2.08) 6 GG/CC 3.04( 1.49) 0.00( 0.00) 0.38( 0.00) 0.81( 0.00) 4.24( 1.49) 7 GC/GC 2.66( 1.03) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 2.86( 1.13) 5.52( 2.16) 8 CG/CG 1.17( 0.04) 0.00( 0.00) 2.75( 0.34) 0.01( 0.00) 3.93( 0.38) 9 GC/GC 7.08( 4.22) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 2.82( 0.87) 9.90( 5.09) 10 CG/CG 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 7.10( 3.75) 0.00( 0.00) 7.10( 3.75) 11 GG/CC 3.93( 2.22) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 4.06( 1.34) 7.99( 3.56) 12 GU/AC 0.06( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.06( 0.00) 13 UC/GA 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 2.78( 1.33) 2.78( 1.33) 14 CG/CG 1.45( 0.58) 0.00( 0.00) 1.68( 0.06) 0.00( 0.00) 3.13( 0.64) 15 GC/GC 7.25( 3.64) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 4.43( 1.60) 11.68( 5.24) 16 CA/UG 1.67( 0.51) 0.00( 0.00) 1.45( 0.62) 0.00( 0.00) 3.12( 1.13) 17 AG/AU 2.26( 2.09) 0.00( 0.00) 0.16( 0.00) 0.51( 0.32) 2.94( 2.41) 18 GG/CA 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.26( 0.00) 0.51( 0.17) 0.77( 0.17) 19 GC/GC 0.86( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 3.53( 0.08) 4.39( 0.08) 20 CU/AG 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.10( 0.00) 2.91( 2.65) 3.02( 2.65) 21 UC/GA 6.15( 3.25) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 3.18( 1.18) 9.33( 4.43) 22 CA/UG 0.00( 0.00) 2.72( 0.81) 0.08( 0.00) 0.00( 0.00) 2.79( 0.81) 23 AG/CU 0.93( 0.03) 0.00( 0.00) 0.83( 0.00) 0.00( 0.00) 1.77( 0.03) 24 GU/UC 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 1.01( 0.00) 1.01( 0.00) 25 UG/UU 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 26 GG/CU 6.51( 3.08) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 2.53( 0.00) 9.04( 3.08) 27 GA/CC 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 28 AU/AC 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00) 0.00( 0.00)