Работа в командной строке Linux.Программы выравнивания последовательностей пакета EMBOSS
	:Главная   :Семестры   :Сайт ФББ
			Работа в командной строке Linux.Программы выравнивания последовательностей пакета EMBOSS Результаты практикума оформлены в виде таблицы. Команда Описание ls Показывает содержимое текущей директории ls .. fbbvb cd ../ls* Выход из поддиректории/Показывает содержимое родительской директории pwd Сообщает полное имя теущей директории more x Позволяет просмотреть файл X *-команда позволяет переместиться в корневую директорию Программы пакета EMBOSS Команда Описание seqret sw:p00000 -auto Принимает на вход последовательность и кладёт её в файл entret sw:p00000 -auto Извлекает из банка запись и кладёт её в файл needle x.fasta y.fasta z.needle -auto Полное парное выравнивание(алгоритм Нидельмана-Вунша) Соответственно результаты выполненных команд здесь: 1.Для команды seqret-hslo_ecoli 2.Для команды entret-hslo_ecoli (Файл содержит запись банка Swiss-Prot) 3.Для команды needle-res1.needle (Здесь лежат результаты выравнивания) При выравнивании со значениями параметров вдвое больших,чем заданных по умолчанию,в выравнивании изменяется только значение Score:вместо 1129.0-1119.0.Выравнивание в формате msf здесь
©Кирилин Евгений,2007