В базе данных PROSITE собрана коллекция сайтов, мотивов и доменов.
Они описаны с помощью паттернов.
С помощью программы ScanProsite (Scan a protein for PROSITE matches) были найдено 30 известных мотивов в последовательности fumarat hydratase class II.
| Идентификатор паттерна (accession number) | Идентификатор документацииPROSITE и краткое описание или название паттерна в соответствии с этим документом | Паттерн (регулярное выражение ) | Число мотивов, обнаруженных в моем белке |
| PS00001 | PDOC00001: сайт N-гликозилирования | N-{P}-[ST]-{P} | 2 |
| PS00005* | PDOC00005: Сайт фосфорилирования белковой киназы С | [ST]-x-[RK] | 8 |
| PS00006* | PDOC00006: Сайт фосфорилирования казеин киназы II | [ST]-x(2)-[DE] | 7 |
| PS00008* | PDOC00008: Сайт N-миристоизации | G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} | 12 |
| PS00163 | PDOC0147: Подпись фумарат лиазы | G-S-x(2)-M-x(2)-K-x-N | 1 |
* - часто встречающиеся в белках мотивы.
G-S-x(2)-M-x(2)-K-x-N - паттерн;
G-S-si-M-pg-K-v-N – этот мотив встретился в моём белке;
G-S-ay-M-il-K-s-N - этот мотив в моём белке не встретился, но он подходит под этот паттерн.