BLAST - инструмент
для быстрого поиска последовательностей в банках данных по гомологии

Использовалась программа BLASTP

Назад    Главная

Поиск белка P05042 по фрагменту его аминокислотной последовательности

Длина фрагментаПорядковый номер хита% совпадающих остатковВес выравниванияE-value
301100%63.51e-10
101100%23.595

Как видно, в первой двадцатке представлены как ортологи(белки разных организмов с одинаковыми функциями; выделены жирным), так и паралоги(белки с разными функциями, имеющие общее происхождение) и прочая ерунда. Т.е ортологи через BLASTP искать нельзя.

 Sequences producing significant alignments:  Score (bits)  E-value 
P36944 RBSR_BACSU Ribose operon repressor6053e-66
Q9K6K2 RBSR_BACHD Ribose operon repressor2507e-63
Q9CF41 RBSR_LACLA Ribose operon repressor2392e-35
P43472 SCRR_PEDPE Sucrose operon repressor ...1489e-35
Q45831 REGA_CLOSA HTH-type transcriptional ...1453e-34
P25144 CCPA_BACSU Catabolite control protein ...1445e-34
Q9CPA2 RBSR_PASMU Ribose operon repressor1432e-31
P58258 REGA_CLOAB HTH-type transcriptional ...1343e-31
Q54430 SCRR_STRMU Sucrose operon repressor ...1348e-31
P06964 CYTR_ECOLI HTH-type transcriptional ...1323e-30
Q56194 CCPA_STAXY Probable catabolite control...1303e-30
P46828 CCPA_BACME Glucose-resistance amylase ...1305e-30
P44329 RBSR_HAEIN Ribose operon repressor1305e-30
P37947 DEGA_BACSU HTH-type transcriptional ...1305e-30
Q8CNV8 CCPA_STAEP Probable catabolite control...1274e-29
P25551 RBSR_ECOLI Ribose operon repressor1251e-28
O68446 PURR_SALTY HTH-type transcriptional ...1242e-28
P15039 PURR_ECOLI HTH-type transcriptional ...1244e-28
P27871 ENDR_PAEPO Probable HTH-type transcrip...1213e-27
Q8NW33 CCPA_STAAW Probable catabolite control...1203e-27