| На главную второго семестра | На главную |
В таблице описаны все мотивы белка BioA_ECOLI, найденные в PROSITE, в том числе неспецифичные (часто встречающиеся).
| Идентификатор документа PROSITE (AC) | Название мотива | Краткое описание мотива | Тип подписи (паттерн, профиль) | Паттерн (регулярное выражение) | Комментарии к регулярному выражению | Специфична ли подпись? | Сколько мотивов нашлось в белке? |
| PS00600 | AA_TRANSFER_CLASS_3 | Aminotransferases class-III pyridoxal-phosphate attachment site | паттерн | [LIVMFYWCS]-[LIVMFYWCAH]-X-D-[ED]-[IVA]-X(2,3)-[GAT]-[LIVMFAGCYN]-X(0,1)-[RSACLIH]-X-[GSADEHRM]-X(10,16)-[DH]-[LIVMFCAG]-[LIVMFYSTAR]-X(2)-[GSA]-K-X(2,3)-[GSTADNV]-[GSAC] | K is the pyridoxal-P attachment site | специфична | 1 |
| PS00006 | CK2_PHOSPHO_SITE | Casein kinase II phosphorylation site | паттерн | [ST]-X(2)-[DE] | S or T is the phosphorylation site | неспецифична | 6 |
| PS00009 | AMIDATION | Amidation site | паттерн | X-G-[RK]-[RK] | x is the amidation site | неспецифична | 1 |
| PS00005 | PKC_PHOSPHO_SITE | Protein kinase C phosphorylation site | паттерн | [ST]-X-[RK] | S or T is the phosphorylation site | неспецифична | 3 |
| PS00008 | MYRISTYL | N-myristoylation site | паттерн | G-{EDRKHPFYW}-X(2)-[STAGCN]-{P} | G is the N - myristoylation site | неспецифична | 3 |
| PS00001 | ASN_GLYCOSYLATION | N-glycosylation site | паттерн | N-{P}-[ST]-{P} | N is the glycosylation site | неспецифична | 1 |
В БД Prosite был проведен поиск мотивов белка BioA_ECOLI по его названию. В результате был найден 1 специфичный пмотив AA_TRANSFER_CLASS_3 и 14 неспецифичных. При этом стоит отметить, большинство неспецифичных мотивов не имеют реального биологического значения.