Эволюционная модель


на главную

Изображение дерева, описанного формулой
((А:85,В:85):15,(((Е:23,F:23):17,D:40):30,С:80):20);


Листья подписаны согласно скобочной формуле. Узлы подписаны согласно листьям, которые будут отходить от этого узла.

Длина гена, кодирующего белок hmp_ecoli - 1191 п.н.

отчет о результатах выполнения упр. I,2-5

Создан скрипт для получения мутантов согласно дереву.

msbar root AB -point 4 -count 179 -auto
msbar root CDEF -point 4 -count 238 -auto
msbar AB A -point 4 -count 1012 -auto
msbar AB B -point 4 -count 1012 -auto
msbar CDEF C -point 4 -count 953 -auto
msbar CDEF DEF -point 4 -count 357 -auto
msbar DEF D -point 4 -count 476 -auto
msbar DEF EF -point 4 -count 202 -auto
msbar EF E -point 4 -count 274 -auto
msbar EF F -point 4 -count 274 -auto
Параметр -point задает тип точечных мутаций и может принимать несколько значений:
0 - нет
1 - все перечисленные
2 - вставки
3 - делеции
4 - замены
5 - дупликации
6 - перемещения
Значение параметра -point равное 4 означает, что все мутации происходили путем замены одного нуклеотида на другой



© Тихонов Максим, 2005