Описание домена
Глобины - гем-содержащие белки вовлеченные в связывание и/или транспорт кислорода. Они принадлежат к хорошо изученному и широко рапространенному во многих организмах семейству. Значительные группы глобинов принадлежат к гемоглобинам и миоглобинам позвоночных, глобинам беспозвоночных, леггемоглобинам расстений и флавогемопротеинам бактерий. Гемоглобин - белок ответственный за транспорт кислорода из легких к другим тканям; является тетрамером, состоящим из двух и двух цепей. Большинство позвоночных имеют специальную эмбриональную или зародышевую форму гемоглабина, где или цепь замещается на цепь с высоким сродством с кислородом, например как гамма, дельта, эпсилон и зета цепи млекопитающих. Магний отвечает за запасание кислорода в мышцах. Большое количество глобинов найдено в беспозвоночных (PUBMED:3138426). Моллюски в целом имеют один или два глобина, которые могут быть как мономерами, так и димерами. Насекомые обладают большим количеством внеклеточных глобинов. Круглые и кольчатые черви имеют разнообразные внутри- и внеклеточные глобины, некоторые из которых полидоменные полипептиды (от 2 до 9), а некоторые образуют большие комплексы, связанные дисульфидными мостиками. Леггемоглобины из корневых клубеньков бобовых растений обеспечивают кислородом симбиотических бактерий.
Флавогемопротеины бактерий и грибов состоят из двух особых доменов. N-концевой глобин и расположенный ближе с C-концу FAD-удерживающий домен (редуктаза). В некоторых бактериях ферменты включающие глобин содержат только его. Все эти глобины, кажется, эволюционировали из общего предка.
|
Распространенность белков с доменом PF00042 по различным таксонам
| Таксон | Количество белков с доменом PF00042 |
| Эукариоты | Растения | 93 |
| Грибы | 21 |
| Животные | 1302 |
| Бактерии | 70 |
| Археи | 0 |
Основные типы доменной архитектуры
- Известно белков с данным доменом: 1741
- Намного чаще встречаются белки с одним единственным доменом; часто встречаются белки где три разных домена (например HMP_ECOLI)
- Есть белки с дупликации домена. Встречаются белки у которых домен копируется до девяти.
- Глобин если встречается с другими доменами, то обязательно в определенном порядке
|
на главную 
