Задание 4 (выполнено Борисовой Мариной)

Задача: вычислить параметры молекулярной динамики (связи, угол между HCH и торсионным углом d3).

V. Результаты зависимости энергии в зависимости от длины связи.

f(x)=a + k*x*x - 2*k*x*b + k*b*b

Итоговые подгоночные параметры:

a = -79.7652 +/- 0.0004523 (0.0005671%)
k = 0.563778 +/- 0.02335 (4.142%)
b = 1.55431 +/- 0.002456 (0.158%)

VI. Результаты зависимости энергии в зависимости от угла НСН.

f(x)=a + k*x*x - 2*k*x*b + k*b*b

Итоговые подгоночные параметры:

a = -79.7647 +/- 1.207e-08 (1.513e-08%)
k = 3.56075e-05 +/- 6.214e-09 (0.01745%)
b = 111.38 +/- 9.931e-05 (8.916e-05%)

В статье о GAFF были следующие параметры:

VII. Результаты зависимости энергии в зависимости от торсионного угла 3d.

На данном графике видно, что фукнция, описывающая зависимости энергии от торсионного угла, имеет 4 минимума в диапазоне от [-180;180].

© 2010-11 Borisova Marina