Для данной записи получили файл с электронной плостностью. В записи 2B5A глутамин 21 цепи C имеет две альтернативных конформации, такие же глутамины трёх других цепей – по одной конформации. С помощью PyMol были получены изображение, на котором были бы видны обе конформации глутамина 21 цепи C и поверхности уровней 1 и 0.5 электронной плотности в окрестности этого остатка. И тоже самое для одного из других трёх глутаминов.
С двумя альтернативными конформациями: Глутамин с одной конформацией (цепь А): Из сравнения электронных плотностей можно заметить, что у глутамина электронная плотность между атомами CG и CD очень низкая. Причём в случае конформации соответствующей нижнему варианту из двух альтернативных даже ниже 0.5.
Изображение остатка пролина-790 цепи А, белый - уровень 2, оранжевый - уровень 1.