ID белка AC белка Число итераций Для первой итерации Для последней итерации Число находок выше порога (0,005) Худшее E-value выше порога Лучшее E-value ниже порога Число находок выше порога (0,005) Худшее E-value выше порога Лучшее E-value ниже порога MINC_ECOLI P18196 4 161 0.005 (MINC_BACWK) 0.005 (MINC_GEOKA) 196 0.005 (FRMA_ECOLI) 0.040 (SECA_ANADF) SSRP_ECOLI P0A832 2 300 8e-15 (SSRP_CAMFF) нет 300 5e-37 (SSRP_POLSQ) нет NUSB_ECOLI P0A780 3 431 0.003(NUSB_RICAH) 0.015 (RSMB_SYNY3) 300 8e-04(RSMB_COXBU) нет FDNG_ECOLI P24183 5 147 0.004 (DMSA_RHOSH) 0.008 (NARG_ECOLI) 197 2e- 24 (T1RE_ECOLX) 0.016 (ILVX_BACSU)
Расходятся итерации для белков P18196 и P24183. Попробуем посмотреть, что произойдёт для повышения и понижения порога (в ячейках указано количество находок в первой итерации - в пятой):
белок\порог 0.001 0.05 0.0005 P18196 154-188 166-500 149-188 P24183 145-193 152-492 145-193 После этих попыток видно, что всё равно итерации не сходятся.
В работах выполненных однокурсниками два года назад получилось добиться того, чтобы итерации сошлись. Возможно, это из-за того, что БД SwissProt пополнилась.