Расшифровка записи SwissProt


На главную Назад
  Метка поля Содержание
Код(ы) доступа ("Accession number") AC P05020
Идентификатор записи в БД ID PYRC_ECOLI
Название (краткое описание) белка DE Digydroorotase (EC 3.5.2.3) (DHOase)
Дата создания документа DT 13-AUG-1987
Дата последнего исправления аннотации DT 05-MAY-2009, entry version 95.
Число публикаций, использованных при создании документа RN 9
Журнал и год самой поздней публикации RL Biochemistry 40:6989-6997(2001)
Ключевые слова KW 3D-structure; Complete proteome; Direct protein sequencing; Hydrolase; Metal-binding; Pyrimidine biosynthesis; Zinc.
Что содержит поле комментариев? CC КАТАЛИТИЧЕСКАЯ АКТИВНОСТЬ: (S) -дигидророоротат + H(2)O = N-карбомил-L-аспарат. КОФАКТОР:Связывание 2 ионов цинка с субъединицей.
МЕТАБОЛИЧЕСКИЙ ПУТЬ: Метаболизм пиримидина.
СУБЪЕДИНИЦА: Гомодимер.
СХОДСТОВО: Принадлежит к семейству дигидрооротаз. Типичный представитель суперсемейства 1.
Идентификаторы записей PDB DR 1J79; 1XGE; 2E25; 2EG6; 2EG7; 2EG8; 2Z24; 2Z25; 2Z26; 2Z27; 2Z28; 2Z29; 2Z2A; 2Z2B

Результаты поиска:


Запрос Число записей в SwissProt Число записей в TrEMBL
Dihydroorotase 322 1902
EC=3.5.2.3 299 1090
DHOase 389 1368

  Метка поля Белок 1 Белок 2
Первый код доступа AC P05020 O66990
Идентификатор последовательности в БД ID PYRC_ECOLI PYRC_AQUAE
Название (краткое описание) белка DE Dihydroorotase; DHOase; EC=3.5.2.3 Dihydroorotase; DHOase; EC=3.5.2.3
Дата создания документа DT 13-AUG-1987 15-DEC-1998
Дата последнего исправления аннотации DT 05-MAY-2009 05-MAY-2009
Название организма OS Escherichia coli (strain K12) Aquifex aeolicus
Классификация организма (список таксонов) OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia. Bacteria; Aquificae; Aquificales; Aquificaceae; Aquifex
Длина последовательности SQ 348 422
Молекулярная масса белка SQ 38827 46380
Число публикаций, использованных при создании документа RN 9 1
Журнал и год самой поздней публикации RL Biochemistry 40:6989-6997(2001) Nature 392:353-358(1998)
Описание вторичной структуры FT Описана вторичная структура: 18 альфа-спиралей, 13 бэта-тяжей, 3 поворота, 2 атома Zn. Описана вторичная структура: 14 альфа-спиралей, 18 бэта-тяжей, 4 поворота, 2 атома Zn/
Ключевые слова KW 3D-structure; Complete proteome; Direct protein sequencing; Hydrolase; Metal-binding; Pyrimidine biosynthesis; Zinc. 3D-structure; Complete proteome; Hydrolase; Metal-binding; Pyrimidine biosynthesis; Zinc.
Темы, освещённые в комментариях CC Каталитическая активность; кофактор; метаболический путь; субъединица; сходство. Каталитическая активность; кофактор; метаболический путь; субъединица; сходство.
Особенности последовательности FT    
Идентификаторы записей PDB DR 1J79; 1XGE; 2E25; 2EG6; 2EG7; 2EG8; 2Z24; 2Z25; 2Z26; 2Z27; 2Z28; 2Z29; 2Z2A; 2Z2B 1XRF; 1XRT; 3D6N
Для сравнения мною был взят белок с точно таким же описанием как и данный мне белок. Сразу бросаются в глаза сходства полей DE, CC (в CC одно лишь отличие: второй белок принадлежит к суперсемейству 2, а не к суперсемейству 1, как первый белок) и KW (у второго белка отсутствует "Direct protein sequencing", а остальное все одно и то же). У этих белков одинаковая функция, оба содержат один и тот же домен Amidohydro_1. В остальном они отличаются друг от друга.
©Базылев Сергей, 2007