Изображение, полученное командой: isodot new_map, 1oyg_map, 1.5, resi 65-67, 2.5
Изображение, полученное командой: isomesh new_map, 1oyg_map, 1.5, resi 65-67, 2.5
А вот аналогичное изображение, но с другим уровнем подрезки - 2,5 вместо 1,5.
Как известно и как видно на этих изображениях, электронная плотность сосредоточена на электроотрицательных атомов, а менее электроотрицательные вблизи них заметно обделены ею.Примечательно, что хуже всего вписан глутамин, а лучше всего - валин.