На главную
Описание доменной структуры TRUA_ECOLI в базе данных Pfam
По идентификатору было найдено описание доменной структуры
TRUA_ECOLI в базе данных
Pfam
Изображение доменной структуры аминокислотной последовательности TRUA_ECOLI
Домен 1
- PF01416 идентификатор Pfam домена
- PseudoU_synth_1 сокращенное название
- Полное название тРНК псевдоуридин синтаза
- Положение домена в последовательности 14-112 а.о.
Домен 2
- PF01416 идентификатор Pfam домена
- PseudoU_synth_1 сокращенное название
- Полное название тРНК псевдоуридин синтаза
- Положение домена в последовательности 151-253 а.о.
Изображение положения доменов в 3D-структуре
Идентификатор PDB 1dj0
Описание семейства доменов, к которому относится
N-концевой домен TRUA_ECOLI
Описание доменов данного типа
тРНК-псевдоуридинсинтаза содержит 1 атом цинка,
необходимый для ее нативной конформации и узнавания тРНК и имеет строго
консервативный остаток аспарагиновой кислоты, участвующей в процессе катализа.
Она участвует в образовании псевдоуридина в позициях 38, 39 и 40 в стебле
антикодона и петле тРНК.
Псевдоуридин - самый часто модифицируемый нуклеозид, найденный в клеточных РНК.
Описание таксонов, в которых встречаются белки с такими доменами
Таксон |
Количество белков с доменом PB009524 |
Эукариоты |
Растения |
12 |
Грибы |
22 |
Животные |
20 |
Бактерии |
147 |
Археи |
16 |
Информация относительно доменной архитектуры:
- Известно 268 белка с доменом PB009524
- Домен PB009524 может быть как единственным,так и с другими доименами.
- Случаев дупликации домена PB009524 240
©
Михайлова Татьяна, 2004