######################################## # Program: needle # Rundate: Thu Nov 09 2006 21:15:54 # Commandline: needle # [-asequence] AAC73234.fasta # [-bsequence] BAB96698.fasta # [-outfile] rez.fasta # -auto # Align_format: srspair # Report_file: rez.fasta ######################################## #======================================= # # Aligned_sequences: 2 # 1: AAC73234 # 2: BAB96698 # Matrix: EDNAFULL # Gap_penalty: 10.0 # Extend_penalty: 0.5 # # Length: 1551 # Identity: 1551/1551 (100.0%) # Similarity: 1551/1551 (100.0%) # Gaps: 0/1551 ( 0.0%) # Score: 7755.0 # # #======================================= AAC73234 1 atgcaacgtcgtgatttcttaaaatattccgtcgcgctgggtgtggcttc 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 1 atgcaacgtcgtgatttcttaaaatattccgtcgcgctgggtgtggcttc 50 AAC73234 51 ggctttgccgctgtggagccgcgcagtatttgcggcagaacgcccaacgt 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 51 ggctttgccgctgtggagccgcgcagtatttgcggcagaacgcccaacgt 100 AAC73234 101 taccgatccctgatttgctcacgaccgatgcccgtaatcgcattcagtta 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 101 taccgatccctgatttgctcacgaccgatgcccgtaatcgcattcagtta 150 AAC73234 151 actattggcgcaggccagtccacctttggcgggaaaactgcaactacctg 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 151 actattggcgcaggccagtccacctttggcgggaaaactgcaactacctg 200 AAC73234 201 gggctataacggcaatctgctggggccggcggtgaaattacagcgcggca 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 201 gggctataacggcaatctgctggggccggcggtgaaattacagcgcggca 250 AAC73234 251 aagcggtaacggttgatatctacaaccaactgacggaagagacaacgttg 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 251 aagcggtaacggttgatatctacaaccaactgacggaagagacaacgttg 300 AAC73234 301 cactggcacgggctggaagtaccgggtgaagtcgacggcggcccgcaggg 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 301 cactggcacgggctggaagtaccgggtgaagtcgacggcggcccgcaggg 350 AAC73234 351 aattattccgccaggtggcaagcgctcggtgacgttgaacgttgatcaac 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 351 aattattccgccaggtggcaagcgctcggtgacgttgaacgttgatcaac 400 AAC73234 401 ctgccgctacctgctggttccatccgcatcagcacggcaaaaccgggcga 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 401 ctgccgctacctgctggttccatccgcatcagcacggcaaaaccgggcga 450 AAC73234 451 caggtggcgatggggctggctgggctggtggtgattgaagatgacgagat 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 451 caggtggcgatggggctggctgggctggtggtgattgaagatgacgagat 500 AAC73234 501 cctgaaattaatgctgccaaaacagtggggtatcgatgatgttccggtga 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 501 cctgaaattaatgctgccaaaacagtggggtatcgatgatgttccggtga 550 AAC73234 551 tcgttcaggataagaaatttagcgccgacgggcagattgattatcaactg 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 551 tcgttcaggataagaaatttagcgccgacgggcagattgattatcaactg 600 AAC73234 601 gatgtgatgaccgccgccgtgggctggtttggcgatacgttgctgaccaa 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 601 gatgtgatgaccgccgccgtgggctggtttggcgatacgttgctgaccaa 650 AAC73234 651 cggtgcaatctacccgcaacacgctgccccgcgtggttggctgcgcctgc 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 651 cggtgcaatctacccgcaacacgctgccccgcgtggttggctgcgcctgc 700 AAC73234 701 gtttgctcaatggctgtaatgcccgttcgctcaatttcgccaccagcgac 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 701 gtttgctcaatggctgtaatgcccgttcgctcaatttcgccaccagcgac 750 AAC73234 751 aatcgcccgctgtatgtgattgccagcgacggtggtctgctacctgaacc 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 751 aatcgcccgctgtatgtgattgccagcgacggtggtctgctacctgaacc 800 AAC73234 801 agtgaaggtgagcgaactgccggtgctgatgggcgagcgttttgaagtgc 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 801 agtgaaggtgagcgaactgccggtgctgatgggcgagcgttttgaagtgc 850 AAC73234 851 tggtggaggttaacgataacaaaccctttgacctggtgacgctgccggtc 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 851 tggtggaggttaacgataacaaaccctttgacctggtgacgctgccggtc 900 AAC73234 901 agccagatggggatggcgattgcgccgtttgataagcctcatccggtaat 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 901 agccagatggggatggcgattgcgccgtttgataagcctcatccggtaat 950 AAC73234 951 gcggattcagccgattgctattagtgcctccggtgctttgccagacacat 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 951 gcggattcagccgattgctattagtgcctccggtgctttgccagacacat 1000 AAC73234 1001 taagtagcctgcctgcgttaccttcgctggaagggctgacggtacgcaag 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 1001 taagtagcctgcctgcgttaccttcgctggaagggctgacggtacgcaag 1050 AAC73234 1051 ctgcaactctctatggacccgatgctcgatatgatggggatgcagatgct 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 1051 ctgcaactctctatggacccgatgctcgatatgatggggatgcagatgct 1100 AAC73234 1101 aatggagaaatatggcgatcaggcgatggccgggatggatcacagccaga 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 1101 aatggagaaatatggcgatcaggcgatggccgggatggatcacagccaga 1150 AAC73234 1151 tgatgggccatatggggcacggcaatatgaatcatatgaaccacggcggg 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 1151 tgatgggccatatggggcacggcaatatgaatcatatgaaccacggcggg 1200 AAC73234 1201 aagttcgatttccaccatgccaacaaaatcaacggtcaggcgtttgatat 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 1201 aagttcgatttccaccatgccaacaaaatcaacggtcaggcgtttgatat 1250 AAC73234 1251 gaacaagccgatgtttgcggcggcgaaagggcaatacgaacgttgggtta 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 1251 gaacaagccgatgtttgcggcggcgaaagggcaatacgaacgttgggtta 1300 AAC73234 1301 tctctggcgtgggcgacatgatgctgcatccgttccatatccacggcacg 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 1301 tctctggcgtgggcgacatgatgctgcatccgttccatatccacggcacg 1350 AAC73234 1351 cagttccgtatcttgtcagaaaatggcaaaccgccagcggctcatcgcgc 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 1351 cagttccgtatcttgtcagaaaatggcaaaccgccagcggctcatcgcgc 1400 AAC73234 1401 gggctggaaagataccgttaaggtagaaggtaatgtcagcgaagtgctgg 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 1401 gggctggaaagataccgttaaggtagaaggtaatgtcagcgaagtgctgg 1450 AAC73234 1451 tgaagtttaatcacgatgcaccgaaagaacatgcttatatggcgcactgc 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 1451 tgaagtttaatcacgatgcaccgaaagaacatgcttatatggcgcactgc 1500 AAC73234 1501 catctgctggagcatgaagatacggggatgatgttagggtttacggtata 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAB96698 1501 catctgctggagcatgaagatacggggatgatgttagggtttacggtata 1550 AAC73234 1551 a 1551 | BAB96698 1551 a 1551 #--------------------------------------- #---------------------------------------