На главную страницу третьего семестра

Cтруктура транслируемых участков гена NEU1


Если понял правильно то структура такова:
6 экзонов
--[81055..81213]--..--[83886..84628]-->
Числа в join не совпадают с экзонами, т.е. из итоговой м-РНК транслируется видимо не всё.
Особенности:
STS 3 шт (сайты легко детектируемые ПЦР и могущие использоваться для картирования генома ***не очень это понял***):
Часть записи касающееся гена NEU1:
FT   exon            80925..81213
FT                   /number=1
FT                   /gene="NEU1"
FT   CDS             join(81055..81213,81640..81832,82381..82643,83210..83392,
FT                   83567..83789,83886..84112)
FT                   /codon_start=1
FT                   /db_xref="GOA:Q99519"
FT                   /db_xref="HGNC:7758"
FT                   /db_xref="HSSP:1EUR"
FT                   /db_xref="InterPro:IPR002860"
FT                   /db_xref="UniProtKB/Swiss-Prot:Q99519"
FT                   /note="alternative name: G9"
FT                   /transl_table=1
FT                   /gene="NEU1"
FT                   /product="lysosomal sialidase"
FT                   /protein_id="BAB63297.1"
FT                   /translation="MTGERPSTALPDRRWGPRILGFWGGCRVWVFAAIFLLLSLAASWS
FT                   KAENDFGLVQPLVTMEQLLWVSGRQIGSVDTFRIPLITATPRGTLLAFAEARKMSSSDE
FT                   GAKFIALRRSMDQGSTWSPTAFIVNDGDVPDGLNLGAVVSDVETGVVFLFYSLCAHKAG
FT                   CQVASTMLVWSKDDGVSWSTPRNLSLDIGTEVFAPGPGSGIQKQREPRKGRLIVCGHGT
FT                   LERDGVFCLLSDDHGASWRYGSGVSGIPYGQPKQENDFNPDECQPYELPDGSVVINARN
FT                   QNNYHCHCRIVLRSYDACDTLRPRDVTFDPELVDPVVAAGAVVTSSGIVFFSNPAHPEF
FT                   RVNLTLRWSFSNGTSWRKETVQLWPGPSGYSSLATLEGSMDGEEQAPQLYVLYEKGRNH
FT                   YTESISVAKISVYGTL"
FT   exon            81640..81832
FT                   /number=2
FT                   /gene="NEU1"
FT   exon            82381..82643
FT                   /number=3
FT                   /gene="NEU1"
FT   exon            83210..83392
FT                   /number=4
FT                   /gene="NEU1"
FT   exon            83567..83789
FT                   /number=5
FT                   /gene="NEU1"
FT   exon            83886..84628
FT                   /number=6
FT                   /gene="NEU1"
FT   STS             84292..84466
FT                   /note="Cda1hd06;The location is between each flanking site
FT                   of PCR primers."
FT   STS             complement(84409..84589)
FT                   /note="stSG9717;The location is between each flanking site
FT                   of PCR primers."
FT   STS             complement(84429..84545)
FT                   /note="WI-8730;The location is between each flanking site
FT                   of PCR primers."
FT                   /standard_name="D6S1884"

©Павел, Мазин