Изображение области связывания MAS с DEF_ECOLI

Мой проект генно-инженерного эксперимента.

приведен список аминокислотных остатков белка B, контактирующих с молекулой M (эти аминокислотные остатки - первые кандидаты для мутагенеза) 97:a,89:a,88:a,132:a,133:a,44:a,43:a,45:a

Предложение замены аминокислотного остатка белка, которая может привести к потере способности связывания цепи А с лигандом: заменить Tyr1034(A) на аланин.

предложена замена аминокислотного остатка белка, которая может привести к потере способности связывания B с М; Если заменить ARG97 на аланин, то это может привести к потере способности связывания молекулы В с М, потому что в радикале аланина отсутствуют атомы азота, которые образуют донорно-акцепторную связь с кислородaми лиганда.

Обоснование. предложена замена аминокислотного остатка белка, контактирующего с M, но тем не менее, предположительно, мало влияющая на способность связывания с М!Замена GLU133 на аспартат, потому что в его остове, как и у глутомата, имеются атомы кислорода, которые возможно взаимодействуют с азотами лиганда.