Программы пакета BLAST для работы с нуклеотидными
последовательностями
Число находок с Е-value<0,001 | 2 | |
Характеристика лучшей находки: | ||
E-value находки | 2e-52 | |
Название геномной последовательности | Pasteurella multocida subsp. multocida str. (Pm70 section 133 of 204 of the complete genome) |
|
Координаты выравнивания(-ий) в найденной последовательности | RimN_Ecoli: 10-190; AE006166: 1261-1803 |
AC: AE004439 FT gene 1462577..1463128 FT /locus_tag="PM1270" FT CDS 1462577..1463128 FT /codon_start=1 FT /transl_table=11 FT /locus_tag="PM1270" FT /product="unknown" FT /db_xref="GOA:Q9CLG4" FT /db_xref="HSSP:1HRU" FT /db_xref="InterPro:IPR006070" FT /db_xref="InterPro:IPR017945" FT /db_xref="UniProtKB/Swiss-Prot:Q9CLG4" FT /protein_id="AAK03354.1" FT /translation="MNIQQIVEQLKQNEVVAYPTEAVFGLGCNPNSESAVQKLLVLKQR FT SVEKGLILVAPCLDYFLPFIDTTAFSQADWDRLQAKYDRPTTWVVPAKTTTPKFLTGQF FT DSIAVRLCDHPAVKQLCEQAGFALTSTSANLTTLPPCRTAEEVKTQFGADFPVLDLPVG FT EATNPSEIRDLFTHQLFRQG"
Число находок с Е-value<0,1 | 12 | |
Характеристика лучшей находки: | ||
E-value находки | 0.24 | |
Название геномной последовательности | Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70 section 26 of 204 of the complete genome. | |
Координаты выравнивания(-ий) в найденной последовательности | RimN_Ecoli: 85-100, AE006059: 934-919; |
Программа | TBLASTN | BLASTN |
Число находок | 2 | 12 |
E-value лучшей находки | 2e-52 | 0.24 |
Координаты выравнивания | 1261-1803 | 934-919 |
Длины выравниваний | 542 | 25 |
Название геномной последовательности | Pasteurella multocida subsp. multocida str. (Pm70 section 133 of 204 of the complete genome) | Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70 section 26 of 204 of the complete genome |