Информация о белке FDNH E.coli из базы Uniprot

Краткая информация о белке
  Метка поля Содержание
Код(ы) доступа ("Accession number") AC P0AAJ3; P24184; P77166;
Идентификатор записи в БД ID FDNH_ECOLI
Название (краткое описание) белка DE Формиатдегидрогеназа, нитрат-адаптивная, содержащая подблок из железа и серы
Дата создания документа DT 11 октября 2005 года
Дата последнего исправления аннотации DT 16 декабря 2008 года
Число публикаций, использованных при создании документа RN 5 публикаций
Журнал и год самой поздней публикации RL журнал Science 295:1863-1868(2002)
Ключевые слова KW 3D-структура, клеточная мембрана, полный протеом, транспорт эелектронов, железо, железо-сера, мембрана, металлосодержащий, трансмембранный, транспорт
Что содержит поле комментариев? CC Поле комментариев содержит информацию о функциях, особенностях состава, количестве цепей,положении относительно клеточной мембраны и принципе работы
Идентификаторы записей PDB DR 1KQF
  Белок FDNH E.coli - трансмембранный, часть его располагается в цитоплазме, часть - в периплазме. Чтобы помешать ему расположиться именно так, на мой взгляд, следовало бы повлиять на аминокислоты под номерами 257-279, которые являеются трасмембранными. Для того, чтобы белок мог выполнять свои функции, из неорганических соединений нужны нитраты, а также соединения железа и серы. Пользуясь поиском на сайте www.uniprot.org, можно найти белки, которые имеют похожее описание. Ниже приведена таблица, в которой отражены характеристики запроса и количество найденных документов.
 Запрос  Число записей
в SwissProt		 Число записей
в TrEMBL
дегидрогеназа (dehydrogenase) нитрат-адаптивный (nitrate-inducible) подблок из железа и серы (iron-sulfur subunit)
16130 (127724
214453 11012742
Среди всех списков записей UniProt была выбрана одна, белок, информация о котором в ней содержится, имеет сходство (хотя довольно отадленное) с белком FDNH E.coli
  Метка поля Белок 1 (FDNH_ECOLI) Белок 2 (FDH_SOLTU)
Первый код доступа AC P0AAJ3 Q07511
Идентификатор последовательности в БД ID FDNH_ECOLI FDH_SOLTU
Название (краткое описание) белка DE Формиатдегидрогеназа, нитрат-адаптивная, содержая подблок серы и железа НАД-зависящая формиатдегидрогеназа
Дата создания документа DT 11 октября 2005 года 1 февраля 1995 года
Дата последнего исправления аннотации DT 16 декабря 2008 года 20 января 2009 года
Название организма OS E.coli Solanum tuberosum
Классификация организма (список таксонов) OC Бактерия, Протеобактерия, Гамма-протеобакретия, семейство Энтеробактерии, Escherichia Эукариоты, Зеленые растения, Наземные растения, Сосудистые растения, Цветковые,семейство Пасленовые,порядок Пасленоцветные, Паслен
Длина последовательности SQ 294 381
Молекулярная масса белка MW 32239 42038
Число публикаций, использованных при создании документа RN 5 5
Журнал и год самой поздней публикации RL Журнал "Science" (2002 год) Журнал "Plant Physiology" (1998 год)
Описание вторичной структуры FT альфа-спирали, бета-слои и повороты в этом поле содержится информация о двух активных центрах белка
Ключевые слова KW 3D-структура, клеточная мембрана, полный протеом, транспорт эелектронов, железо, железо-сера, мембрана, металлосодержащий, трансмембранный, транспорт НАД, оксидоредуктаза, транспорт пептидов, митохондрия
Темы, освещённые в комментариях CC Функции, особенности состава, количество цепей,положение относительно клеточной мембраны и принцип работы Функции, каталитическая активность, расположение в клетке,тканевая спецефичность,условия внутриклеточного синтеза, классификация
Особенности последовательности
 FT с первой по 294 аминокислоты последовательности расположены в периплазме, с 257 по 279 - проходят через мембрану, с 280 по 294 - в цитоплазме в белке имеется два активных центра
Идентификаторы записей PDB DR 1KQF -