Мотивы в белке DKGA_ECOLI, описанные в БД Prosite


Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00798 ALDOKETO_REDUCTASE_1 1-я подпись семейства Aldo/keto reductase паттерн G-[FY]-R-[HSAL]-[LIVMF]-D-[STAGCL]-[AS]-x(5)-[EQ]-x(2)-[LIVMCA]-G специфична 1
PS00062 ALDOKETO_REDUCTASE_2 2-я подпись семейства Aldo/keto reductase паттерн [LIVMFY]-x(8)-{L}-[KREQ]-{K}-[LIVM]-G-[LIVM]-[SC]-N-[FY] специфична 1
PS00063 ALDOKETO_REDUCTASE_3 подпись семейства Aldo/keto reductase, возможно являющаяся активным сайтом паттерн [LIVM]-[PAIV]-[KR]-[ST]-{EPQG}-x(3)-R-{SVAF}-x-[GSTAEQK]-[NSL]-x(2)-[LIVMFA] специфична 1
PS00008 MYRISTIL сайт N-миристоилирования паттерн G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} неспецифична 3
PS00006 CK2_PHOSPHO_SITE сайт фосфорилирования казеикиназой 2 паттерн [ST]-x(2)-[DE] неспецифична 1
PS00007 TYR_PHOSPHO_SITE сайт фосфорилирования тирозинкиназой паттерн [RK]-x(2)-[DE]-x(3)-Y или [RK]-x(3)-[DE]-x(2)-Y неспецифична 1
PS00001 ASN_GLYCOSYLATION сайт N-гликозилирования паттерн N-{P}-[ST]-{P} неспецифична 2
PS00005 PKC_PHOSPHO_SITE сайт фосфорилирования протеинкиназой С паттерн [ST]-x-[RK] неспецифична 3
PS00009 AMIDATION сайт присоединения амидной группы паттерн x-G-[RK]-[RK] неспецифична 1

В таблице приведены мотивы, встречающиеся в белке DKGA_ECOLI. Специфичные подписи соответствуют принадлежности белка к определенному семейству. Также эти участки отвечают за выполнение белком своей функции. Неспецифические мотивы указывают на участки, встречающиеся у многих белков с разными функциями и отвечающими за какие-то общие взаимодействия (фосфорилирование, гликозилирование, присоединение амидной группы). Наличие специфических мотивов (как и специфических доменов) может помочь с выяснением функции белка, неспецифических - выяснить способы его работы.

На страницу 2-го семестра

© Моросанова Мария