Торсионные углы

Торсионные углы φ и ψ

Точечная диаграмма зависимости торсионных углов φ и ψ, в которой по оси абсцисс откладывается φ, а по оси ординат - ψ и углы меняются от -180´ до 180º, называется картой Рамачандрана.

&phi (Phi); - торсионный угол, характеризующий вращение вокруг связи между атомом N и Cαрассматриваемой аминокислоты.
&psi (Psi); - торсионный угол, характеризующий вращение вокруг связи между атомом С(О)и Cα одной аминокислоты.
Ниже приведены карты Рамачандрана для участка цепи В белка в 1OWB и для всей цепи B


Торсионные углы небольшого участка цепи B (Структура: Альфа-спираль)
Точки наверху - это, возможно, граничные остатки спирали.


Торсионные углы цепи B.Точки, образующие большое скопление на участке фи (-120,-40) и пси (-60,30) соответствуют альфа-спирали, выше - бета-тяжи. Участки, выпадающие из общих скоплений, возможно, соответствуют глицину, так как значения его торсионных углов могут меняться достаточно широко.


 Назад

2008 ©