| Метка поля | Содержание |
| Код(ы) доступа ("Accession number") | AC | P0A6Y1; P08756; |
| Идентификатор записи в БД | ID | IHFB_ECOLI |
| Название (краткое описание) белка | DE | Integration host factor субчастица B; IHF-Betta |
| Дата создания документа | DT | 07.06.2005 |
| Дата последнего исправления аннотации | DT | 16.12.2008 |
| Число публикаций, использованных при создании документа | RN | 8 |
| Журнал и год самой поздней публикации | RL | Mol. Syst. Biol.(2006) |
| Ключевые слова | KW | 3D-structure; Complete proteome; Direct protein sequencing;DNA recombination; DNA-binding; Transcription;Transcription regulation; Translation regulation. |
| Что содержит поле комментариев? | CC | Function:Этот белок - одна из субъединиц integration host фактора. Это ДНК-связывающий белок участвующий в репликации генов а также, контролирующий транскрипцию и трансляцию
Function:Белок играет ключевую роль в лизогенном жизнненном цикле бактериофага lambda т.к. он необходим нетолько для реакции рекомбинации, не6обходимой для встраивания ДНК lambda в хромосому E.coli но и для регуляции int и cI репрессоров: белков бактериофага, необходимых для встраивания и репрессии соответственно. Синтез int и cI происходит ненаправленно IHF при помощи белка cII бактериофага.
Subunit: Гетеродимер, состоящий из A и B субъединиц
Similarity:Принадлежит к семейству бактериальных гистоно-подобных белков |
| Идентификаторы записей PDB | DR | PDB; 1IHF; X-ray; 2.20 A; B=1-94.
PDB; 1OUZ; X-ray; 2.41 A; B=1-94.
PDB; 1OWF; X-ray; 1.95 A; B=1-94.
PDB; 1OWG; X-ray; 2.10 A; B=1-94.
PDB; 2HT0; X-ray; 2.00 A; B=1-94. |
3). Согласно статьи "The isolation and characterization of mutants of the integration host factor (IHF)
of Escherichia coli with altered, expanded DNA-bindingspecificities." EMBO J. 11:305-313(1992).
(MEDLINE=92155171; PubMed=1531459;) были изучены мутации субъединицы B в подиции 44 (Glu to Lys, Val or Gly (Глутутаминовая кислота на Лизин Валин или Глицин))-следствие изменение "DNA binding specifity" (Поле FT)
4).
| |
Метка поля |
Белок 1 |
Белок 2 |
| Первый код доступа |
AC |
P0A6Y1 |
Q51473 |
| Идентификатор последовательности в БД |
ID |
IHFB_ECOLI |
IHFB_PSEAE |
| Название (краткое описание) белка |
DE |
Full=Integration host factor subunit beta;Short=IHF-beta; |
Full=Integration host factor subunit beta;Short=IHF-beta; |
| Дата создания документа |
DT |
07-JUN-2005 |
01-NOV-1997 |
| Дата последнего исправления аннотации |
DT |
16-DEC-2008 |
25-NOV-2008 |
| Название организма |
OS |
Escherichia coli (strain K12) |
Pseudomonas aeruginosa. |
| Классификация организма (список таксонов) |
|
|
|
| Длина последовательности |
OC |
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia. |
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas. |
| Молекулярная масса белка |
SQ |
10651 |
10632 |
| Число публикаций, использованных при
создании документа |
RN |
8 |
5 |
| Журнал и год самой поздней публикации |
RL |
Mol. syst. Biol. 2006 |
Nature 2000 |
Описание вторичной структуры
Укажите, есть ли такое описание, и в чем оно состоит. |
CC |
Heterodimer of an alpha and a beta chain. Belongs to the bacterial histone-like protein family. |
Heterodimer of an alpha and a beta chain. Belongs to the bacterial histone-like protein family. |
| Ключевые слова |
KW |
3D-structure; Complete proteome; Direct protein sequencing;DNA recombination; DNA-binding; Transcription Transcription regulation; Translation regulation. |
Complete proteome; DNA recombination; DNA-binding; Transcription;
KW Transcription regulation; Translation regulation. |
| Темы, освещённые в комментариях |
CC |
Function,Subunit,similarity. |
Function,Subunit,similarity. |
Особенности последовательности
Не копируйте, а перечислите, какие особенности
отражены в документе! |
FT |
Chain length=94, Mutagen in 44, Conflicts 9; 90, order of Hekixes, strands, terns (features of secondary structures)) |
Chain length=94 |
| Идентификаторы записей PDB |
DR |
PDB; 1IHF; X-ray; 2.20 A; B=1-94.PDB; 1OUZ; X-ray; 2.41 A; B=1-94.PDB; 1OWF; X-ray; 1.95 A; B=1-94.PDB; 1OWG; X-ray; 2.10 A; B=1-94.PDB; 2HT0; X-ray; 2.00 A; B=1-94. |
- |
