Учебный сайт Люды Андреевой


Поиск PubMed

В базе данных PubMed (пройти по ссылке) находятся статьи на разных языках по большому количеству научных направлений.

  • Найдём ссылки на статьи, в которых упоминается полное имя белка BIOH_ECOLI, а именно carboxylesterase bioH. Для этого в строку поиска введём следующую информацию:
    carboxylesterase[All Fields] AND bioH[All Fields]).
    Результатом этого запроса стали 2 статьи, названия и авторов которых можно найти здесь.
    Поскольку статей очень мало, я решила искать по альтернативному имени белка - Biotin synthesis protein bioH. Для этой цели был составлен запрос:
    ((("biotin"[MeSH Terms] OR "biotin"[All Fields]) AND ("metabolism"[MeSH Terms] OR "metabolism"[All Fields] OR "synthesis"[All Fields])) AND ("proteins"[MeSH Terms] OR "proteins"[All Fields] OR "protein"[All Fields])) AND bioH[All Fields],
    результатом которого стали 9 статей (названия и авторов см.здесь).

  • Выберем из этих статей "Integrating structure, bioinformatics, and enzymology to discover function: BioH, a new carboxylesterase from Escherichia coli." как статью, в которой имя белка упоминается уже в названии. Её авторы - Sanishvili R, Yakunin AF, Laskowski RA, Skarina T, Evdokimova E, Doherty-Kirby A, Lajoie GA, Thornton JM, Arrowsmith CH, Savchenko A, Joachimiak A, Edwards AM. Аннотацию статьи смотрите здесь.

  • Составим запрос для поиска статей последнего автора описанной выше, которые написаны за последние 3 года (2007, 2008, 2009 и часть 2006):
    Edwards AM[Author] AND ("2006/03/07"[PDat] : "2009/03/05"[PDat]),
    в результате которого были найдены 34 статьи. Результаты поиска можно посмотреть в этом файле.

  • Теперь поищем ссылки на статьи об опоясывающем лишае (shingles). Его разговорное название звучит как "herpes zoster" (во всяком случае, именно его PubMed определяет как часто употребляемы синоним). Для этого просто введём в поисковую строку название болезни - shingles - и обнаружим 11187 публикаций. Вот аннотации некоторых из них.

Мной также были выполнены дополнительные задания.


©Andreeva_2008