первый семестр

Результаты поиска в интернете

Задание. Найти в Интернете сведения, позволяющие ответить на вопрос,
                почему данный организм был выбран для секвенирования генома.

Daphnia pulex


Фотография скопирована с сайта www.aquaria.com.ua/dapfnia.html
(автор фотографии не указан).


Причины по которым дафния была выбрана для секвенирования генома:
  1. Дафния — важное звено в цепи питания (питаются водорсолями и служат кормом для рыб)
  2. Давно исследуются экологами и зоологами по всему миру.
  3. Легко культивируется.
  4. В размножении длительный период бесполого разножения (летом у самок) аналогичный коловраткам.
  5. Огромное число особей.
  6. Маленький размер генома.
  7. Очень чуствительны к изменениям условий окружающей среды.
  8. Ещё одна замечательная черта дафний — прозрачность, что в несколько раз облегчает наблюдения.

Дополнительная информация:
  • Расшифровка генома этого животного ещё не завершена, но должна закончиться в этом году
  • Завершена расшифровка митохондриального генома дафнии
  • Русское название — Дафния пулекс

Neisseria meningitidis MC58


Фотография представлена на сайте http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=genomeprj&cmd=Retrieve&dopt=Overview&list_uids=251 .
Авторы фотографии :
I.Boulton и S.Gray-Owen
(в Nat Immunol, 2002 год, третий том, стр.:229-236).
Причины по которым дафния была выбрана для секвенирования генома: Безусловно, основная причина, по которой был расшифрован геном этого организма, его патогенность. Это одна из двух Neisseria которые вызывает у человека заболевания. Она вызывает менингит, то есть сейчас учёные всерьёз занимаются разработкой вакцины (вакцины от менингита до сих пор нет!). Более подробное обоснование на сайте
Дополнительная информация:
  • У штамма Neisseria meningitidis MC58 секвенирование ДНК уже завершено.
  • Длина генома у бактерии — 2,27 Mbp, то есть 1540 раз меньше, чем у человека.
  • Степнь родства Neisseria meningitidis MC58 с Escherichia coli K-12 — далёкие родственники.
    Таксономическое описание Neisseria meningitidis MC58:
    • группа Протеобактерий,
    • класс бета-протеобактерий,
    • порядок Neisseriales,
    • семейство Neisseriaceae,
    • род Neisseria
    • вид meningitidis
    • штамм MC58.

©Евгений Лёушкин