Элемент вторичной структуры белка
Образование водородных связей между бета-тяжами в белке вторичной структуры происходит отнюдь не хаотичным образом. Существует закономерность образования водородных связей между атомами карбоксильных групп одной цепи и атомами амидных групп другой цепи. Из рисунка следует,что эти связи образовались между карбоксильными атомами № 58,60,62 и соответствующими амидными атомами № 75,73,71 что свидетельствует об антипаралллельности цепей.Этот характер связи между бета-тяжами подчинён правилу "паттерна". Происходит связь: N73 (val)---O60 (glu) ; N60 (glu)---O73 (val). N62 (lys)---O71 (tyr) ; N71 (tyr)---O62 (lys). Для получения данного изображения следует выполнить следующие команды: restrict 54-81:A backbone 90 select (oxygen,nitrogen,carbon) cpk 100 color cpk hbond label val81,lys76,val77... color label yellow ©Терешкова Алеся,2008 |