Торсионные углы


Первый семестр

Распределение углов phi и psi в (Arg 54-Val 81) бета-тяже белка

Получение точечной диаграммы (для соответсвующего бета-тяжа или для всей цепи А) :

select structure

phipsi

сохраняем

Затем данные переносим в Excel и по данным значениям строим точечную диаграмму углов Phi и Psi

Вывод по диаграмме: Значения углов phi и psi для какого-либо аминокислотного остатка характеризуют его положение во вторичной структуре

Угол phi - угол вращения вокруг связи N-C(альфа); угол psi - угол вращения вокруг связи C(альфа)-C(O).

Средние значения углов бета-тяжа(в градусах):

phi = -82.17

psi=105.06

Распределение углов phi и psi во всей цепи белка

Как видно из анализа верхней и нижней диаграммы,для бета-тяжей характерно точечное расположение в верхней части второго квадранта. Это рисунок отображается как на структуре одного бета-тяжа,так и на всём белке бета типа.


©Терешкова Алеся,2008