Состав записи банка PDB


Первый семестр

Информация о белке экотин в записи 1ecy,представленная в банке PDB

Компоненты структуры, описанной в документе PDB 1ECY

Заголовок структуры:Protease Inhibitor <Ингибитор протеиназы>

Название структуры: Protease Inhibitor Ecotin <Ингибитор протеиназы ECOTIN>

В документе представлены следующие цепи макромолекул:

Идентификатор цепи Число остатков Название молекулы Комментарии
A 142 Protease Inhibitor Ecotin Ecotin

В документе представлены следующие низкомолекулярные вещества, связанные с белком:

ID(идентификатор) Название Формула  Число копий Комментарии
GLC Glucose C6 H12 O6 2 Глюкоза 
BGC Beta-D-Glucose C6 H12 O6 5 Бета-D-Глюкоза
HOH Water H2O 20 Вода 
Описание цепи A белка экотин:
Изображение остовной модели:

Для того,чтобы получить изображение остовной модели я набирала следующие команды:

restrict none

select *:A

backbone 70


Для того,чтобы получить изображение вторичной структуры:

restrict none

select *:A

structure

color structure

Изображение вторичной структуры цепи:

Количество альфа-спиралей<малиновый цвет>:2
Количество бета-тяжей<желтый цвет>:12
Количество бета-повортов<синий цвет>:12

Из рисунка видно,что:
-основная структурная единица белка-бета-тяж;
-присутствуют всего две,причём небольшие,альфа-спирали.
Вывод:у меня белок бета типа.

©Терешкова Алеся,2008