Prosite представляет собой базу данных для поиска мотивов в аминокислотных последовательностях. Поиск осуществляется по паттернам (что является наиболее «устаревшим» способом поиска, чем использованием матрицы HMM, которая является более современным способом,использующимся в Pfam),а также по правилам и при помощи профилей (построенных на основе матриц PSSM,и этот способ является самым современным способом при работе с Prosite). Pfam является базой данных для поиска структурных и функциональных доменов в последовательностях белков. Поиск осуществляется при помощи профилей HMM. InterPro представляет собой базу данных-совокупность Pfam и Prosite. InterPro является базой данных семейств белков, доменов и функциональных сайтов,мотивов в изученных белках, и полученные данные могут быть применены к неизученным последовательностям белков.

Задание:
1) Найти известные мотивы в последовательности, используя Prosite.
2) Придумать последовательность, идеально удовлетворяющую одному из паттернов.
3) Найти домены в белке при помощи Pfam, описать домены.
4) Изучить свойства первой записи, полученной с помощью InterPro, при поиске доменов в белке.