Моя структура очень похожа на гантелю.
В длину она 97,8 ангстрем, ширина в самом широком месте 45 ангстрем,
расстояние до "перетяжки" 45,4 ангстрем. В ленточной модели видно, что
бета-слои каждой цепи параллельны друг другу.На основе проведенных измерений
структуру можно аппроксимировать сферой радиусом примерно 50 ангстрем.
Получается, что есть клетка E.coli, аппроксимированная в цилиндр с диаметром
10 * 10 -5 м и высотой 2*10-6 м. И белок, аппроксимированный в сферу, диаметром
10*10-11 м. Таким образом, в клетку должно войти в высоту 2*10-6/10-8= 200
молекул, а по ширине в самом широком месте поместиться 100 молекул.
Площадь квадрата =А2 А=100/21/2 .
Следовательно площадь квадрата =5000. Т.е. в квадрат войдет 5000 молекул.
А далее можно аппроксимировать клетку E.coli не в цилиндр, а в параллелепипед
высотой 2 и шириной 1 микрометр. Тогда в клетке поместиться 200*5000=1 000 000
молекул))).
Если 4400 видов белка E.coli синтезировать одновременно в
одинаковых количествах и их размеры будут равны размеру моего белка, то в клетке
каждый белок будет представлен1 000 000/4400=227 молекулами.
Современные фирмы создают кристаллы CPU с точностью до 0,13 микрометров
На линейке размером 0,13 микрометрометров поместится
0.13*10-6\10*10-11=130 молекул белка.
Лучший световой микроскоп имеет разрешающую способность около 0.2 мкм
(или 200 нм),
то есть чтобы создать объект,
видимый под световым микроскопом необходимо взять 2*10-7/10-8=20 молекул.
| |
Взаимное расположение и формы цепей белка | |
|
|
Расположение альфа-спиралей в одной из цепей в ленточной модели | Расположение бета-тяжей в одной из цепей в ленточной модели |