Первый семестр

Форма белка


Моя структура очень похожа на гантелю. В длину она 97,8 ангстрем, ширина в самом широком месте 45 ангстрем, расстояние до "перетяжки" 45,4 ангстрем. В ленточной модели видно, что бета-слои каждой цепи параллельны друг другу.На основе проведенных измерений структуру можно аппроксимировать сферой радиусом примерно 50 ангстрем. Получается, что есть клетка E.coli, аппроксимированная в цилиндр с диаметром 10 * 10 -5 м и высотой 2*10-6 м. И белок, аппроксимированный в сферу, диаметром 10*10-11 м. Таким образом, в клетку должно войти в высоту 2*10-6/10-8= 200 молекул, а по ширине в самом широком месте поместиться 100 молекул. Площадь квадрата =А2 А=100/21/2 . Следовательно площадь квадрата =5000. Т.е. в квадрат войдет 5000 молекул. А далее можно аппроксимировать клетку E.coli не в цилиндр, а в параллелепипед высотой 2 и шириной 1 микрометр. Тогда в клетке поместиться 200*5000=1 000 000 молекул))).
Если 4400 видов белка E.coli синтезировать одновременно в одинаковых количествах и их размеры будут равны размеру моего белка, то в клетке каждый белок будет представлен1 000 000/4400=227 молекулами.
Современные фирмы создают кристаллы CPU с точностью до 0,13 микрометров На линейке размером 0,13 микрометрометров поместится 0.13*10-6\10*10-11=130 молекул белка.
Лучший световой микроскоп имеет разрешающую способность около 0.2 мкм (или 200 нм), то есть чтобы создать объект, видимый под световым микроскопом необходимо взять 2*10-7/10-8=20 молекул.

Взаимное расположение и формы цепей белка


Расположение альфа-спиралей в одной из цепей в ленточной модели Расположение бета-тяжей в одной из цепей в ленточной модели


©MARIA KUZNETSOVA,2007