|
Бета-тяжи 42-49:g и 55-62:g
Chain: G Group: ILE 42 (S) Phi = -123.8 Psi = 141.1
Chain: G Group: THR 43 (S) Phi = -128.2 Psi = 122.2
Chain: G Group: ILE 44 (S) Phi = -124.2 Psi = 139.6
Chain: G Group: GLY 45 (S) Phi = -133.0 Psi = 117.8
Chain: G Group: LEU 46 (S) Phi = -110.5 Psi = 143.3
Chain: G Group: ASN 47 (S) Phi = 63.0 Psi = 25.6
Chain: G Group: LEU 48 (S) Phi = -67.1 Psi = 154.5
Chain: G Group: PRO 49 (S) Phi = -67.5 Psi = 145.8
Chain: G Group: ARG 55 (S) Phi = -135.5 Psi = 150.0
Chain: G Group: LYS 56 (S) Phi = -152.0 Psi = 161.6
Chain: G Group: ASP 57 (S) Phi = -103.6 Psi = 152.7
Chain: G Group: LEU 58 (S) Phi = -145.4 Psi = 127.9
Chain: G Group: ILE 59 (S) Phi = -124.1 Psi = 138.6
Chain: G Group: LYS 60 (S) Phi = -132.3 Psi = 127.2
Chain: G Group: ILE 61 (S) Phi = -117.6 Psi = 139.5
Chain: G Group: GLU 62 (S) Phi = -91.9 Psi = 127.1
Суммарно всего 16 остатков.
макс мин среднее
фи 63 -152 -105,85625
пси 161,6 25,6 132,15625
Краткое описание расположение водородных связей
54 55 56 57 58 59 60 61 62
NCCNCCNCCNCCNCCNCCNCCNCC
| | | | | |
CCNCCNCCNCCNCCNCCNCCNCCN
49 48 47 46 45 44 43 42
Водородные связи образованы между N и C атомами через одну аминокислоту(по две водородных связи на одну)
Записать зависимость для бесконечной нтипараллельной бета-структуры можно так:
Н(А-2n;В+2n)-Н(В+2n;А-2n)
………………………..
Н(А-2;В+2)-Н(В+2;А-2)
Н(А;В)-Н(В;А)
Н(А+2;В-2)-Н(В-2;А+2)
………………………….
Н(А+2n;В-2n), Н(В-2n;А+2n)
Н(А+2n;В-2n), Н(В-2n;А+2n),
где “n” относится к множеству натуральных чисел, а А и В – номера соответствующих а.о..
| контакты бета-тяжей 42-49:g и 55-62:g |
| Имя атома остатка бета-тяжа |
Имя контактирующего атома |
Расстояние в A |
Предположительная природа контакта |
| Ile44:G.O |
Ile18:G.N |
3.06 |
водородная связь |
| Asp57G.O |
Ile21G.N |
3.19 |
водородная связь |
| Asn47:G.CB |
Arg41:J. |
|
гидрофобное взаимовоздействие |
| Lys56:G.CA |
His20:G.CA |
4.75 |
гидрофобное взаимовоздействие |
|
Карта Рамачандана для множества всех остатков цепи G
|
 |
|
Водородные связи внутри бета-слоёв. Подписаны номер и трёхбуквенное обозначение аминокислоты, которые образуют водороднкю связь
|  |
Главная страница
Первый семестр
|