Создание выборки белков с одинаковыми функциями
Задача - создать выборку белков, выполняющих ту же функцию, что бактериоферритин.
Часть 1.Краткое описание прототипа по данным банка аминокислотных последовательностей Swiss-Prot, release 28.02.2004
Часть 2. Описание процедуры составления выборки
При поиске мы использовали поисковую систему SRS, веб-сервер http://srs.ebi.ac.uk, в поле DESCRIPTION мы писали полное название белка (bacterioferritin), в поле SPECIES - название организмов (Escherichia coli, Agrobacterium tumefaciens, Yersinia pestis), в поле TAXONOMY- название таксона (Bacteria, Gammaproteobacteria, Firmicutes, Archae, Eukaryota). Для поиска были использованы банки данных UniProt/SwissProt.
Форма запроса:
Часть 3. Описание выборки
Критерии включаемости последовательности в выборку:
1)белок обладает теми же описаниями функций, что и исходный;
2)белок должен отличаться от исходного по строению, должен находиться в разных (желательно родственных организмах).


НА ГЛАВНУЮ